Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z6B0

CCDC91, Coiled-coil domain-containing protein 91, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC91Q7Z6B0 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC91Q7Z6B0 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC91Q7Z6B0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC91Q7Z6B0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC91Q7Z6B0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC91Q7Z6B0 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC91Q7Z6B0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC91Q7Z6B0 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC91Q7Z6B0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC91Q7Z6B0 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC91Q7Z6B0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC91Q7Z6B0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC91Q7Z6B0 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC91Q7Z6B0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC91Q7Z6B0 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC91Q7Z6B0 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC91Q7Z6B0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC91Q7Z6B0 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC91Q7Z6B0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC91Q7Z6B0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC91Q7Z6B0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC91Q7Z6B0 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC91Q7Z6B0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC91Q7Z6B0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC91Q7Z6B0 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC91Q7Z6B0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC91Q7Z6B0 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC91Q7Z6B0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC91Q7Z6B0 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC91Q7Z6B0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC91Q7Z6B0 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC91Q7Z6B0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC91Q7Z6B0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC91Q7Z6B0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC91Q7Z6B0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC91Q7Z6B0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC91Q7Z6B0 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC91Q7Z6B0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC91Q7Z6B0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC91Q7Z6B0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC91Q7Z6B0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC91Q7Z6B0 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC91Q7Z6B0 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC91Q7Z6B0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC91Q7Z6B0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC91Q7Z6B0 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC91Q7Z6B0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC91Q7Z6B0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC91Q7Z6B0 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC91Q7Z6B0 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC91Q7Z6B0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC91Q7Z6B0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC91Q7Z6B0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.88
CCDC91Q7Z6B0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC91Q7Z6B0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC91Q7Z6B0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC91Q7Z6B0 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC91Q7Z6B0 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC91Q7Z6B0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC91Q7Z6B0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC91Q7Z6B0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC91Q7Z6B0 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC91Q7Z6B0 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC91Q7Z6B0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC91Q7Z6B0 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC91Q7Z6B0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC91Q7Z6B0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC91Q7Z6B0 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC91Q7Z6B0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC91Q7Z6B0 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC91Q7Z6B0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC91Q7Z6B0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC91Q7Z6B0 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC91Q7Z6B0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC91Q7Z6B0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC91Q7Z6B0 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC91Q7Z6B0 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC91Q7Z6B0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC91Q7Z6B0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC91Q7Z6B0 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC91Q7Z6B0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC91Q7Z6B0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC91Q7Z6B0 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC91Q7Z6B0 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC91Q7Z6B0 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC91Q7Z6B0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC91Q7Z6B0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC91Q7Z6B0 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC91Q7Z6B0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC91Q7Z6B0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC91Q7Z6B0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC91Q7Z6B0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC91Q7Z6B0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC91Q7Z6B0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC91Q7Z6B0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC91Q7Z6B0 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC91Q7Z6B0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC91Q7Z6B0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC91Q7Z6B0 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC91Q7Z6B0 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms