Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSG1

RNF165, E3 ubiquitin-protein ligase RNF165, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF165Q6ZSG1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
RNF165Q6ZSG1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RNF165Q6ZSG1 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
RNF165Q6ZSG1 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RNF165Q6ZSG1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RNF165Q6ZSG1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RNF165Q6ZSG1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RNF165Q6ZSG1 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RNF165Q6ZSG1 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RNF165Q6ZSG1 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RNF165Q6ZSG1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RNF165Q6ZSG1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RNF165Q6ZSG1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RNF165Q6ZSG1 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RNF165Q6ZSG1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RNF165Q6ZSG1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RNF165Q6ZSG1 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RNF165Q6ZSG1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RNF165Q6ZSG1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RNF165Q6ZSG1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RNF165Q6ZSG1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RNF165Q6ZSG1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RNF165Q6ZSG1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RNF165Q6ZSG1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RNF165Q6ZSG1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RNF165Q6ZSG1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RNF165Q6ZSG1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RNF165Q6ZSG1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RNF165Q6ZSG1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RNF165Q6ZSG1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RNF165Q6ZSG1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RNF165Q6ZSG1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RNF165Q6ZSG1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RNF165Q6ZSG1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RNF165Q6ZSG1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RNF165Q6ZSG1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RNF165Q6ZSG1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RNF165Q6ZSG1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RNF165Q6ZSG1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RNF165Q6ZSG1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RNF165Q6ZSG1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RNF165Q6ZSG1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RNF165Q6ZSG1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RNF165Q6ZSG1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RNF165Q6ZSG1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RNF165Q6ZSG1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
RNF165Q6ZSG1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RNF165Q6ZSG1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RNF165Q6ZSG1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RNF165Q6ZSG1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
RNF165Q6ZSG1 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RNF165Q6ZSG1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RNF165Q6ZSG1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RNF165Q6ZSG1 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RNF165Q6ZSG1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RNF165Q6ZSG1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RNF165Q6ZSG1 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RNF165Q6ZSG1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RNF165Q6ZSG1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RNF165Q6ZSG1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RNF165Q6ZSG1 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RNF165Q6ZSG1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RNF165Q6ZSG1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RNF165Q6ZSG1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
RNF165Q6ZSG1 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RNF165Q6ZSG1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RNF165Q6ZSG1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RNF165Q6ZSG1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RNF165Q6ZSG1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RNF165Q6ZSG1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RNF165Q6ZSG1 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RNF165Q6ZSG1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RNF165Q6ZSG1 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RNF165Q6ZSG1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RNF165Q6ZSG1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RNF165Q6ZSG1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RNF165Q6ZSG1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RNF165Q6ZSG1 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RNF165Q6ZSG1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RNF165Q6ZSG1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RNF165Q6ZSG1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RNF165Q6ZSG1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
RNF165Q6ZSG1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RNF165Q6ZSG1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RNF165Q6ZSG1 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RNF165Q6ZSG1 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RNF165Q6ZSG1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RNF165Q6ZSG1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RNF165Q6ZSG1 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
RNF165Q6ZSG1 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RNF165Q6ZSG1 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RNF165Q6ZSG1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
RNF165Q6ZSG1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RNF165Q6ZSG1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RNF165Q6ZSG1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RNF165Q6ZSG1 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RNF165Q6ZSG1 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
RNF165Q6ZSG1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RNF165Q6ZSG1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RNF165Q6ZSG1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms