Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZS94

C1orf229, Putative uncharacterized protein C1orf229, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf229Q6ZS94 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C1orf229Q6ZS94 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
C1orf229Q6ZS94 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C1orf229Q6ZS94 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1orf229Q6ZS94 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C1orf229Q6ZS94 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C1orf229Q6ZS94 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
C1orf229Q6ZS94 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C1orf229Q6ZS94 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C1orf229Q6ZS94 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C1orf229Q6ZS94 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C1orf229Q6ZS94 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C1orf229Q6ZS94 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C1orf229Q6ZS94 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C1orf229Q6ZS94 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C1orf229Q6ZS94 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C1orf229Q6ZS94 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C1orf229Q6ZS94 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C1orf229Q6ZS94 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C1orf229Q6ZS94 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C1orf229Q6ZS94 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C1orf229Q6ZS94 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C1orf229Q6ZS94 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C1orf229Q6ZS94 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C1orf229Q6ZS94 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C1orf229Q6ZS94 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C1orf229Q6ZS94 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C1orf229Q6ZS94 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C1orf229Q6ZS94 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C1orf229Q6ZS94 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C1orf229Q6ZS94 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C1orf229Q6ZS94 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C1orf229Q6ZS94 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C1orf229Q6ZS94 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C1orf229Q6ZS94 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C1orf229Q6ZS94 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C1orf229Q6ZS94 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C1orf229Q6ZS94 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C1orf229Q6ZS94 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C1orf229Q6ZS94 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C1orf229Q6ZS94 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C1orf229Q6ZS94 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C1orf229Q6ZS94 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1orf229Q6ZS94 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1orf229Q6ZS94 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C1orf229Q6ZS94 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C1orf229Q6ZS94 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C1orf229Q6ZS94 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C1orf229Q6ZS94 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1orf229Q6ZS94 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1orf229Q6ZS94 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1orf229Q6ZS94 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1orf229Q6ZS94 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1orf229Q6ZS94 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1orf229Q6ZS94 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1orf229Q6ZS94 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
C1orf229Q6ZS94 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1orf229Q6ZS94 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1orf229Q6ZS94 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1orf229Q6ZS94 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1orf229Q6ZS94 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1orf229Q6ZS94 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1orf229Q6ZS94 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1orf229Q6ZS94 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1orf229Q6ZS94 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1orf229Q6ZS94 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C1orf229Q6ZS94 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C1orf229Q6ZS94 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C1orf229Q6ZS94 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C1orf229Q6ZS94 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C1orf229Q6ZS94 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C1orf229Q6ZS94 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C1orf229Q6ZS94 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C1orf229Q6ZS94 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C1orf229Q6ZS94 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C1orf229Q6ZS94 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C1orf229Q6ZS94 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C1orf229Q6ZS94 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C1orf229Q6ZS94 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C1orf229Q6ZS94 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C1orf229Q6ZS94 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
C1orf229Q6ZS94 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C1orf229Q6ZS94 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
C1orf229Q6ZS94 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C1orf229Q6ZS94 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
C1orf229Q6ZS94 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C1orf229Q6ZS94 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C1orf229Q6ZS94 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C1orf229Q6ZS94 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C1orf229Q6ZS94 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C1orf229Q6ZS94 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C1orf229Q6ZS94 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C1orf229Q6ZS94 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C1orf229Q6ZS94 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
C1orf229Q6ZS94 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C1orf229Q6ZS94 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C1orf229Q6ZS94 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C1orf229Q6ZS94 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C1orf229Q6ZS94 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C1orf229Q6ZS94 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms