Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPM2

IQCE, IQ domain-containing protein E, humanhuman

Predictions only

Length 695 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IQCEQ6IPM2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
IQCEQ6IPM2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
IQCEQ6IPM2 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
IQCEQ6IPM2 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
IQCEQ6IPM2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
IQCEQ6IPM2 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
IQCEQ6IPM2 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
IQCEQ6IPM2 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
IQCEQ6IPM2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
IQCEQ6IPM2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
IQCEQ6IPM2 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
IQCEQ6IPM2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
IQCEQ6IPM2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
IQCEQ6IPM2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
IQCEQ6IPM2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
IQCEQ6IPM2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
IQCEQ6IPM2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
IQCEQ6IPM2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
IQCEQ6IPM2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
IQCEQ6IPM2 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
IQCEQ6IPM2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
IQCEQ6IPM2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
IQCEQ6IPM2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
IQCEQ6IPM2 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
IQCEQ6IPM2 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
IQCEQ6IPM2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
IQCEQ6IPM2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
IQCEQ6IPM2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
IQCEQ6IPM2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
IQCEQ6IPM2 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
IQCEQ6IPM2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
IQCEQ6IPM2 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
IQCEQ6IPM2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
IQCEQ6IPM2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
IQCEQ6IPM2 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
IQCEQ6IPM2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
IQCEQ6IPM2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
IQCEQ6IPM2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
IQCEQ6IPM2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
IQCEQ6IPM2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
IQCEQ6IPM2 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
IQCEQ6IPM2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
IQCEQ6IPM2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
IQCEQ6IPM2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
IQCEQ6IPM2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
IQCEQ6IPM2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC29.02■■■□□ 2.24
IQCEQ6IPM2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
IQCEQ6IPM2 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
IQCEQ6IPM2 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
IQCEQ6IPM2 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
IQCEQ6IPM2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
IQCEQ6IPM2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
IQCEQ6IPM2 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
IQCEQ6IPM2 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
IQCEQ6IPM2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
IQCEQ6IPM2 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
IQCEQ6IPM2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
IQCEQ6IPM2 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
IQCEQ6IPM2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
IQCEQ6IPM2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
IQCEQ6IPM2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
IQCEQ6IPM2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
IQCEQ6IPM2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
IQCEQ6IPM2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
IQCEQ6IPM2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
IQCEQ6IPM2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
IQCEQ6IPM2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
IQCEQ6IPM2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
IQCEQ6IPM2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
IQCEQ6IPM2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
IQCEQ6IPM2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
IQCEQ6IPM2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
IQCEQ6IPM2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
IQCEQ6IPM2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
IQCEQ6IPM2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
IQCEQ6IPM2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
IQCEQ6IPM2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
IQCEQ6IPM2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
IQCEQ6IPM2 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
IQCEQ6IPM2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
IQCEQ6IPM2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
IQCEQ6IPM2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
IQCEQ6IPM2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
IQCEQ6IPM2 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
IQCEQ6IPM2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
IQCEQ6IPM2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
IQCEQ6IPM2 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
IQCEQ6IPM2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
IQCEQ6IPM2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
IQCEQ6IPM2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
IQCEQ6IPM2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
IQCEQ6IPM2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
IQCEQ6IPM2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
IQCEQ6IPM2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
IQCEQ6IPM2 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
IQCEQ6IPM2 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
IQCEQ6IPM2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
IQCEQ6IPM2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
IQCEQ6IPM2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
IQCEQ6IPM2 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms