Protein–RNA interactions for Protein: Q6EMK4

VASN, Vasorin, humanhuman

Predictions only

Length 673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VASNQ6EMK4 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
VASNQ6EMK4 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VASNQ6EMK4 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VASNQ6EMK4 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VASNQ6EMK4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
VASNQ6EMK4 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
VASNQ6EMK4 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
VASNQ6EMK4 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
VASNQ6EMK4 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
VASNQ6EMK4 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
VASNQ6EMK4 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VASNQ6EMK4 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
VASNQ6EMK4 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VASNQ6EMK4 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
VASNQ6EMK4 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VASNQ6EMK4 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VASNQ6EMK4 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
VASNQ6EMK4 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
VASNQ6EMK4 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
VASNQ6EMK4 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VASNQ6EMK4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VASNQ6EMK4 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VASNQ6EMK4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VASNQ6EMK4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
VASNQ6EMK4 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VASNQ6EMK4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VASNQ6EMK4 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VASNQ6EMK4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VASNQ6EMK4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
VASNQ6EMK4 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VASNQ6EMK4 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VASNQ6EMK4 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VASNQ6EMK4 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
VASNQ6EMK4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VASNQ6EMK4 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
VASNQ6EMK4 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
VASNQ6EMK4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VASNQ6EMK4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VASNQ6EMK4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VASNQ6EMK4 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VASNQ6EMK4 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VASNQ6EMK4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
VASNQ6EMK4 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
VASNQ6EMK4 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VASNQ6EMK4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VASNQ6EMK4 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VASNQ6EMK4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
VASNQ6EMK4 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
VASNQ6EMK4 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VASNQ6EMK4 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
VASNQ6EMK4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VASNQ6EMK4 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VASNQ6EMK4 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
VASNQ6EMK4 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
VASNQ6EMK4 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
VASNQ6EMK4 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
VASNQ6EMK4 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VASNQ6EMK4 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
VASNQ6EMK4 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VASNQ6EMK4 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
VASNQ6EMK4 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
VASNQ6EMK4 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VASNQ6EMK4 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VASNQ6EMK4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VASNQ6EMK4 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VASNQ6EMK4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VASNQ6EMK4 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VASNQ6EMK4 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VASNQ6EMK4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VASNQ6EMK4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VASNQ6EMK4 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VASNQ6EMK4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VASNQ6EMK4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VASNQ6EMK4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VASNQ6EMK4 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VASNQ6EMK4 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VASNQ6EMK4 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VASNQ6EMK4 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
VASNQ6EMK4 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
VASNQ6EMK4 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
VASNQ6EMK4 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VASNQ6EMK4 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VASNQ6EMK4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
VASNQ6EMK4 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VASNQ6EMK4 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VASNQ6EMK4 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VASNQ6EMK4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VASNQ6EMK4 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
VASNQ6EMK4 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VASNQ6EMK4 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VASNQ6EMK4 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
VASNQ6EMK4 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VASNQ6EMK4 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
VASNQ6EMK4 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
VASNQ6EMK4 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
VASNQ6EMK4 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
VASNQ6EMK4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
VASNQ6EMK4 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
VASNQ6EMK4 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
VASNQ6EMK4 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.4 ms