Protein–RNA interactions for Protein: Q6DKK2

TTC19, Tetratricopeptide repeat protein 19, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC19Q6DKK2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TTC19Q6DKK2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TTC19Q6DKK2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TTC19Q6DKK2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TTC19Q6DKK2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TTC19Q6DKK2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TTC19Q6DKK2 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TTC19Q6DKK2 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TTC19Q6DKK2 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TTC19Q6DKK2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TTC19Q6DKK2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TTC19Q6DKK2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TTC19Q6DKK2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TTC19Q6DKK2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TTC19Q6DKK2 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TTC19Q6DKK2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TTC19Q6DKK2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TTC19Q6DKK2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TTC19Q6DKK2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TTC19Q6DKK2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
TTC19Q6DKK2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TTC19Q6DKK2 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TTC19Q6DKK2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TTC19Q6DKK2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TTC19Q6DKK2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TTC19Q6DKK2 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TTC19Q6DKK2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TTC19Q6DKK2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
TTC19Q6DKK2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TTC19Q6DKK2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TTC19Q6DKK2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TTC19Q6DKK2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TTC19Q6DKK2 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TTC19Q6DKK2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TTC19Q6DKK2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TTC19Q6DKK2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TTC19Q6DKK2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TTC19Q6DKK2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TTC19Q6DKK2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TTC19Q6DKK2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TTC19Q6DKK2 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TTC19Q6DKK2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TTC19Q6DKK2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TTC19Q6DKK2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TTC19Q6DKK2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TTC19Q6DKK2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TTC19Q6DKK2 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TTC19Q6DKK2 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TTC19Q6DKK2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TTC19Q6DKK2 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TTC19Q6DKK2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TTC19Q6DKK2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TTC19Q6DKK2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TTC19Q6DKK2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TTC19Q6DKK2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TTC19Q6DKK2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TTC19Q6DKK2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TTC19Q6DKK2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TTC19Q6DKK2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TTC19Q6DKK2 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TTC19Q6DKK2 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TTC19Q6DKK2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TTC19Q6DKK2 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TTC19Q6DKK2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TTC19Q6DKK2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TTC19Q6DKK2 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.91
TTC19Q6DKK2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
TTC19Q6DKK2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
TTC19Q6DKK2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TTC19Q6DKK2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TTC19Q6DKK2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TTC19Q6DKK2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TTC19Q6DKK2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TTC19Q6DKK2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TTC19Q6DKK2 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TTC19Q6DKK2 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TTC19Q6DKK2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TTC19Q6DKK2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TTC19Q6DKK2 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TTC19Q6DKK2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TTC19Q6DKK2 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TTC19Q6DKK2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TTC19Q6DKK2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TTC19Q6DKK2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TTC19Q6DKK2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TTC19Q6DKK2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TTC19Q6DKK2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TTC19Q6DKK2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TTC19Q6DKK2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TTC19Q6DKK2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TTC19Q6DKK2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TTC19Q6DKK2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TTC19Q6DKK2 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TTC19Q6DKK2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TTC19Q6DKK2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TTC19Q6DKK2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TTC19Q6DKK2 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TTC19Q6DKK2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TTC19Q6DKK2 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TTC19Q6DKK2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms