Protein–RNA interactions for Protein: Q5JTN6

WDR38, WD repeat-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR38Q5JTN6 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
WDR38Q5JTN6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
WDR38Q5JTN6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
WDR38Q5JTN6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
WDR38Q5JTN6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
WDR38Q5JTN6 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
WDR38Q5JTN6 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
WDR38Q5JTN6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
WDR38Q5JTN6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
WDR38Q5JTN6 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
WDR38Q5JTN6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
WDR38Q5JTN6 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
WDR38Q5JTN6 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
WDR38Q5JTN6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
WDR38Q5JTN6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
WDR38Q5JTN6 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
WDR38Q5JTN6 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
WDR38Q5JTN6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
WDR38Q5JTN6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
WDR38Q5JTN6 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
WDR38Q5JTN6 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
WDR38Q5JTN6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
WDR38Q5JTN6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
WDR38Q5JTN6 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
WDR38Q5JTN6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
WDR38Q5JTN6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
WDR38Q5JTN6 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
WDR38Q5JTN6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
WDR38Q5JTN6 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
WDR38Q5JTN6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
WDR38Q5JTN6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
WDR38Q5JTN6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
WDR38Q5JTN6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
WDR38Q5JTN6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
WDR38Q5JTN6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
WDR38Q5JTN6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
WDR38Q5JTN6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
WDR38Q5JTN6 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
WDR38Q5JTN6 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
WDR38Q5JTN6 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
WDR38Q5JTN6 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
WDR38Q5JTN6 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
WDR38Q5JTN6 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
WDR38Q5JTN6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
WDR38Q5JTN6 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
WDR38Q5JTN6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
WDR38Q5JTN6 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
WDR38Q5JTN6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
WDR38Q5JTN6 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
WDR38Q5JTN6 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
WDR38Q5JTN6 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
WDR38Q5JTN6 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
WDR38Q5JTN6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
WDR38Q5JTN6 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
WDR38Q5JTN6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
WDR38Q5JTN6 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
WDR38Q5JTN6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
WDR38Q5JTN6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
WDR38Q5JTN6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
WDR38Q5JTN6 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
WDR38Q5JTN6 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
WDR38Q5JTN6 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
WDR38Q5JTN6 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
WDR38Q5JTN6 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
WDR38Q5JTN6 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
WDR38Q5JTN6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
WDR38Q5JTN6 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
WDR38Q5JTN6 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
WDR38Q5JTN6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
WDR38Q5JTN6 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
WDR38Q5JTN6 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
WDR38Q5JTN6 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
WDR38Q5JTN6 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
WDR38Q5JTN6 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
WDR38Q5JTN6 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
WDR38Q5JTN6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
WDR38Q5JTN6 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
WDR38Q5JTN6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
WDR38Q5JTN6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
WDR38Q5JTN6 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
WDR38Q5JTN6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
WDR38Q5JTN6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
WDR38Q5JTN6 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
WDR38Q5JTN6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
WDR38Q5JTN6 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
WDR38Q5JTN6 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
WDR38Q5JTN6 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
WDR38Q5JTN6 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
WDR38Q5JTN6 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
WDR38Q5JTN6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
WDR38Q5JTN6 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
WDR38Q5JTN6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
WDR38Q5JTN6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
WDR38Q5JTN6 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
WDR38Q5JTN6 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
WDR38Q5JTN6 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
WDR38Q5JTN6 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
WDR38Q5JTN6 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
WDR38Q5JTN6 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
WDR38Q5JTN6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.4 ms