Protein–RNA interactions for Protein: Q5JQC4

CT47A1, Cancer/testis antigen 47A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CT47A1Q5JQC4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CT47A1Q5JQC4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
CT47A1Q5JQC4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CT47A1Q5JQC4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CT47A1Q5JQC4 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CT47A1Q5JQC4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CT47A1Q5JQC4 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CT47A1Q5JQC4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CT47A1Q5JQC4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CT47A1Q5JQC4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CT47A1Q5JQC4 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CT47A1Q5JQC4 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CT47A1Q5JQC4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CT47A1Q5JQC4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CT47A1Q5JQC4 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CT47A1Q5JQC4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CT47A1Q5JQC4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CT47A1Q5JQC4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CT47A1Q5JQC4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CT47A1Q5JQC4 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CT47A1Q5JQC4 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CT47A1Q5JQC4 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CT47A1Q5JQC4 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CT47A1Q5JQC4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
CT47A1Q5JQC4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CT47A1Q5JQC4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CT47A1Q5JQC4 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CT47A1Q5JQC4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CT47A1Q5JQC4 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CT47A1Q5JQC4 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CT47A1Q5JQC4 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CT47A1Q5JQC4 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CT47A1Q5JQC4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CT47A1Q5JQC4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CT47A1Q5JQC4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CT47A1Q5JQC4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CT47A1Q5JQC4 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CT47A1Q5JQC4 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
CT47A1Q5JQC4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CT47A1Q5JQC4 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CT47A1Q5JQC4 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CT47A1Q5JQC4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CT47A1Q5JQC4 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CT47A1Q5JQC4 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CT47A1Q5JQC4 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CT47A1Q5JQC4 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CT47A1Q5JQC4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CT47A1Q5JQC4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CT47A1Q5JQC4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CT47A1Q5JQC4 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CT47A1Q5JQC4 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CT47A1Q5JQC4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CT47A1Q5JQC4 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CT47A1Q5JQC4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CT47A1Q5JQC4 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CT47A1Q5JQC4 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CT47A1Q5JQC4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CT47A1Q5JQC4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CT47A1Q5JQC4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CT47A1Q5JQC4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CT47A1Q5JQC4 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CT47A1Q5JQC4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CT47A1Q5JQC4 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CT47A1Q5JQC4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CT47A1Q5JQC4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CT47A1Q5JQC4 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CT47A1Q5JQC4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CT47A1Q5JQC4 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CT47A1Q5JQC4 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
CT47A1Q5JQC4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CT47A1Q5JQC4 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CT47A1Q5JQC4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CT47A1Q5JQC4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CT47A1Q5JQC4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CT47A1Q5JQC4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CT47A1Q5JQC4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CT47A1Q5JQC4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CT47A1Q5JQC4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CT47A1Q5JQC4 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CT47A1Q5JQC4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CT47A1Q5JQC4 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CT47A1Q5JQC4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CT47A1Q5JQC4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CT47A1Q5JQC4 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CT47A1Q5JQC4 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CT47A1Q5JQC4 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CT47A1Q5JQC4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CT47A1Q5JQC4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CT47A1Q5JQC4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CT47A1Q5JQC4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CT47A1Q5JQC4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
CT47A1Q5JQC4 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CT47A1Q5JQC4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CT47A1Q5JQC4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CT47A1Q5JQC4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CT47A1Q5JQC4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CT47A1Q5JQC4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
CT47A1Q5JQC4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CT47A1Q5JQC4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CT47A1Q5JQC4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms