Protein–RNA interactions for Protein: Q4VXA5

KHDC1, KH homology domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KHDC1Q4VXA5 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
KHDC1Q4VXA5 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
KHDC1Q4VXA5 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
KHDC1Q4VXA5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
KHDC1Q4VXA5 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
KHDC1Q4VXA5 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KHDC1Q4VXA5 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KHDC1Q4VXA5 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KHDC1Q4VXA5 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
KHDC1Q4VXA5 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KHDC1Q4VXA5 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
KHDC1Q4VXA5 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KHDC1Q4VXA5 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KHDC1Q4VXA5 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
KHDC1Q4VXA5 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KHDC1Q4VXA5 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
KHDC1Q4VXA5 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
KHDC1Q4VXA5 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
KHDC1Q4VXA5 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KHDC1Q4VXA5 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KHDC1Q4VXA5 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KHDC1Q4VXA5 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KHDC1Q4VXA5 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KHDC1Q4VXA5 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KHDC1Q4VXA5 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KHDC1Q4VXA5 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KHDC1Q4VXA5 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KHDC1Q4VXA5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KHDC1Q4VXA5 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KHDC1Q4VXA5 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KHDC1Q4VXA5 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
KHDC1Q4VXA5 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KHDC1Q4VXA5 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KHDC1Q4VXA5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
KHDC1Q4VXA5 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
KHDC1Q4VXA5 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KHDC1Q4VXA5 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
KHDC1Q4VXA5 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
KHDC1Q4VXA5 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
KHDC1Q4VXA5 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KHDC1Q4VXA5 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KHDC1Q4VXA5 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
KHDC1Q4VXA5 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KHDC1Q4VXA5 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KHDC1Q4VXA5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
KHDC1Q4VXA5 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
KHDC1Q4VXA5 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
KHDC1Q4VXA5 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
KHDC1Q4VXA5 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
KHDC1Q4VXA5 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
KHDC1Q4VXA5 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
KHDC1Q4VXA5 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
KHDC1Q4VXA5 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
KHDC1Q4VXA5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
KHDC1Q4VXA5 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
KHDC1Q4VXA5 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
KHDC1Q4VXA5 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KHDC1Q4VXA5 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KHDC1Q4VXA5 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
KHDC1Q4VXA5 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
KHDC1Q4VXA5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
KHDC1Q4VXA5 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
KHDC1Q4VXA5 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
KHDC1Q4VXA5 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
KHDC1Q4VXA5 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
KHDC1Q4VXA5 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
KHDC1Q4VXA5 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
KHDC1Q4VXA5 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
KHDC1Q4VXA5 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
KHDC1Q4VXA5 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KHDC1Q4VXA5 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KHDC1Q4VXA5 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KHDC1Q4VXA5 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KHDC1Q4VXA5 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
KHDC1Q4VXA5 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KHDC1Q4VXA5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KHDC1Q4VXA5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KHDC1Q4VXA5 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KHDC1Q4VXA5 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KHDC1Q4VXA5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KHDC1Q4VXA5 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KHDC1Q4VXA5 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KHDC1Q4VXA5 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
KHDC1Q4VXA5 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KHDC1Q4VXA5 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
KHDC1Q4VXA5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KHDC1Q4VXA5 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KHDC1Q4VXA5 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
KHDC1Q4VXA5 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KHDC1Q4VXA5 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KHDC1Q4VXA5 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
KHDC1Q4VXA5 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
KHDC1Q4VXA5 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
KHDC1Q4VXA5 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
KHDC1Q4VXA5 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KHDC1Q4VXA5 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KHDC1Q4VXA5 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
KHDC1Q4VXA5 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
KHDC1Q4VXA5 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
KHDC1Q4VXA5 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms