Protein–RNA interactions for Protein: Q4VC31

CCDC58, Coiled-coil domain-containing protein 58, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC58Q4VC31 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC58Q4VC31 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC58Q4VC31 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC58Q4VC31 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC58Q4VC31 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC58Q4VC31 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC58Q4VC31 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC58Q4VC31 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC58Q4VC31 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC58Q4VC31 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC58Q4VC31 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC58Q4VC31 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC58Q4VC31 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC58Q4VC31 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC58Q4VC31 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC58Q4VC31 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC58Q4VC31 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC58Q4VC31 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC58Q4VC31 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC58Q4VC31 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC58Q4VC31 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC58Q4VC31 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC58Q4VC31 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC58Q4VC31 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC58Q4VC31 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC58Q4VC31 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC58Q4VC31 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC58Q4VC31 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC58Q4VC31 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC58Q4VC31 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC58Q4VC31 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC58Q4VC31 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC58Q4VC31 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC58Q4VC31 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC58Q4VC31 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC58Q4VC31 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC58Q4VC31 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC58Q4VC31 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC58Q4VC31 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC58Q4VC31 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC58Q4VC31 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC58Q4VC31 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC58Q4VC31 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC58Q4VC31 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC58Q4VC31 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC58Q4VC31 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC58Q4VC31 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC58Q4VC31 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC58Q4VC31 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC58Q4VC31 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC58Q4VC31 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC58Q4VC31 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC58Q4VC31 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC58Q4VC31 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC58Q4VC31 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC58Q4VC31 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC58Q4VC31 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC58Q4VC31 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC58Q4VC31 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC58Q4VC31 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC58Q4VC31 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC58Q4VC31 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC58Q4VC31 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC58Q4VC31 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC58Q4VC31 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC58Q4VC31 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC58Q4VC31 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC58Q4VC31 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC58Q4VC31 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC58Q4VC31 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC58Q4VC31 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC58Q4VC31 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC58Q4VC31 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC58Q4VC31 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC58Q4VC31 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC58Q4VC31 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC58Q4VC31 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC58Q4VC31 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC58Q4VC31 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC58Q4VC31 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC58Q4VC31 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC58Q4VC31 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC58Q4VC31 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC58Q4VC31 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC58Q4VC31 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC58Q4VC31 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC58Q4VC31 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC58Q4VC31 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC58Q4VC31 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC58Q4VC31 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC58Q4VC31 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC58Q4VC31 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC58Q4VC31 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC58Q4VC31 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC58Q4VC31 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC58Q4VC31 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC58Q4VC31 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC58Q4VC31 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC58Q4VC31 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC58Q4VC31 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms