Protein–RNA interactions for Protein: Q494X3

ZNF404, Zinc finger protein 404, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF404Q494X3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF404Q494X3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF404Q494X3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF404Q494X3 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF404Q494X3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF404Q494X3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF404Q494X3 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF404Q494X3 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF404Q494X3 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF404Q494X3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF404Q494X3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF404Q494X3 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF404Q494X3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF404Q494X3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF404Q494X3 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF404Q494X3 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF404Q494X3 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
ZNF404Q494X3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNF404Q494X3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNF404Q494X3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF404Q494X3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF404Q494X3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF404Q494X3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF404Q494X3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF404Q494X3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF404Q494X3 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF404Q494X3 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF404Q494X3 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF404Q494X3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF404Q494X3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF404Q494X3 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF404Q494X3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF404Q494X3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF404Q494X3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF404Q494X3 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZNF404Q494X3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZNF404Q494X3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNF404Q494X3 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNF404Q494X3 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNF404Q494X3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNF404Q494X3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF404Q494X3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF404Q494X3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF404Q494X3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF404Q494X3 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF404Q494X3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF404Q494X3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF404Q494X3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF404Q494X3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNF404Q494X3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNF404Q494X3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF404Q494X3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF404Q494X3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZNF404Q494X3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZNF404Q494X3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZNF404Q494X3 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZNF404Q494X3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZNF404Q494X3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZNF404Q494X3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZNF404Q494X3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZNF404Q494X3 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZNF404Q494X3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZNF404Q494X3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZNF404Q494X3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZNF404Q494X3 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZNF404Q494X3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZNF404Q494X3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZNF404Q494X3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNF404Q494X3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNF404Q494X3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNF404Q494X3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF404Q494X3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF404Q494X3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF404Q494X3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF404Q494X3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF404Q494X3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF404Q494X3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF404Q494X3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF404Q494X3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF404Q494X3 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF404Q494X3 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF404Q494X3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF404Q494X3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF404Q494X3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF404Q494X3 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF404Q494X3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF404Q494X3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF404Q494X3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF404Q494X3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF404Q494X3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF404Q494X3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZNF404Q494X3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF404Q494X3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF404Q494X3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF404Q494X3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF404Q494X3 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF404Q494X3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF404Q494X3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF404Q494X3 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF404Q494X3 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms