Protein–RNA interactions for Protein: Q2NL82

TSR1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR1Q2NL82 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
TSR1Q2NL82 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TSR1Q2NL82 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TSR1Q2NL82 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TSR1Q2NL82 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TSR1Q2NL82 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TSR1Q2NL82 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TSR1Q2NL82 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TSR1Q2NL82 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TSR1Q2NL82 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TSR1Q2NL82 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
TSR1Q2NL82 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
TSR1Q2NL82 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
TSR1Q2NL82 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TSR1Q2NL82 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TSR1Q2NL82 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TSR1Q2NL82 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TSR1Q2NL82 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TSR1Q2NL82 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TSR1Q2NL82 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TSR1Q2NL82 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TSR1Q2NL82 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TSR1Q2NL82 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TSR1Q2NL82 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
TSR1Q2NL82 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TSR1Q2NL82 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TSR1Q2NL82 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TSR1Q2NL82 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TSR1Q2NL82 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
TSR1Q2NL82 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TSR1Q2NL82 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TSR1Q2NL82 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TSR1Q2NL82 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TSR1Q2NL82 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TSR1Q2NL82 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TSR1Q2NL82 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TSR1Q2NL82 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TSR1Q2NL82 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TSR1Q2NL82 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TSR1Q2NL82 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TSR1Q2NL82 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TSR1Q2NL82 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TSR1Q2NL82 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TSR1Q2NL82 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TSR1Q2NL82 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TSR1Q2NL82 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TSR1Q2NL82 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TSR1Q2NL82 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TSR1Q2NL82 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
TSR1Q2NL82 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TSR1Q2NL82 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TSR1Q2NL82 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TSR1Q2NL82 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TSR1Q2NL82 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TSR1Q2NL82 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TSR1Q2NL82 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TSR1Q2NL82 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TSR1Q2NL82 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TSR1Q2NL82 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TSR1Q2NL82 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TSR1Q2NL82 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
TSR1Q2NL82 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
TSR1Q2NL82 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TSR1Q2NL82 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TSR1Q2NL82 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TSR1Q2NL82 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TSR1Q2NL82 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TSR1Q2NL82 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TSR1Q2NL82 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TSR1Q2NL82 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TSR1Q2NL82 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TSR1Q2NL82 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TSR1Q2NL82 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TSR1Q2NL82 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TSR1Q2NL82 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TSR1Q2NL82 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TSR1Q2NL82 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TSR1Q2NL82 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TSR1Q2NL82 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TSR1Q2NL82 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TSR1Q2NL82 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TSR1Q2NL82 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TSR1Q2NL82 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TSR1Q2NL82 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TSR1Q2NL82 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TSR1Q2NL82 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TSR1Q2NL82 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TSR1Q2NL82 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TSR1Q2NL82 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TSR1Q2NL82 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TSR1Q2NL82 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TSR1Q2NL82 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TSR1Q2NL82 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TSR1Q2NL82 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TSR1Q2NL82 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TSR1Q2NL82 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TSR1Q2NL82 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
TSR1Q2NL82 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TSR1Q2NL82 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
TSR1Q2NL82 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.1 ms