Protein–RNA interactions for Protein: Q16864

ATP6V1F, V-type proton ATPase subunit F, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1FQ16864 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ATP6V1FQ16864 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ATP6V1FQ16864 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ATP6V1FQ16864 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP6V1FQ16864 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP6V1FQ16864 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP6V1FQ16864 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP6V1FQ16864 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP6V1FQ16864 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP6V1FQ16864 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP6V1FQ16864 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP6V1FQ16864 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP6V1FQ16864 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP6V1FQ16864 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP6V1FQ16864 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP6V1FQ16864 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP6V1FQ16864 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP6V1FQ16864 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP6V1FQ16864 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP6V1FQ16864 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP6V1FQ16864 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
ATP6V1FQ16864 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP6V1FQ16864 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP6V1FQ16864 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP6V1FQ16864 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATP6V1FQ16864 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATP6V1FQ16864 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATP6V1FQ16864 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATP6V1FQ16864 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATP6V1FQ16864 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATP6V1FQ16864 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATP6V1FQ16864 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP6V1FQ16864 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP6V1FQ16864 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP6V1FQ16864 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATP6V1FQ16864 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATP6V1FQ16864 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP6V1FQ16864 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP6V1FQ16864 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP6V1FQ16864 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP6V1FQ16864 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP6V1FQ16864 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP6V1FQ16864 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP6V1FQ16864 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP6V1FQ16864 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP6V1FQ16864 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP6V1FQ16864 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP6V1FQ16864 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP6V1FQ16864 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP6V1FQ16864 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP6V1FQ16864 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP6V1FQ16864 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP6V1FQ16864 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP6V1FQ16864 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP6V1FQ16864 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP6V1FQ16864 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP6V1FQ16864 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP6V1FQ16864 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP6V1FQ16864 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP6V1FQ16864 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP6V1FQ16864 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP6V1FQ16864 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP6V1FQ16864 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP6V1FQ16864 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATP6V1FQ16864 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP6V1FQ16864 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP6V1FQ16864 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP6V1FQ16864 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP6V1FQ16864 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP6V1FQ16864 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP6V1FQ16864 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP6V1FQ16864 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP6V1FQ16864 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP6V1FQ16864 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATP6V1FQ16864 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATP6V1FQ16864 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATP6V1FQ16864 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATP6V1FQ16864 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
ATP6V1FQ16864 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATP6V1FQ16864 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATP6V1FQ16864 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATP6V1FQ16864 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATP6V1FQ16864 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
ATP6V1FQ16864 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATP6V1FQ16864 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATP6V1FQ16864 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATP6V1FQ16864 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATP6V1FQ16864 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATP6V1FQ16864 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ATP6V1FQ16864 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ATP6V1FQ16864 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATP6V1FQ16864 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATP6V1FQ16864 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
ATP6V1FQ16864 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATP6V1FQ16864 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATP6V1FQ16864 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATP6V1FQ16864 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATP6V1FQ16864 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATP6V1FQ16864 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
ATP6V1FQ16864 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
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