Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
FXNQ16595 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FXNQ16595 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FXNQ16595 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FXNQ16595 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FXNQ16595 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FXNQ16595 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FXNQ16595 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FXNQ16595 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FXNQ16595 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FXNQ16595 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FXNQ16595 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FXNQ16595 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
FXNQ16595 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FXNQ16595 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FXNQ16595 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FXNQ16595 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FXNQ16595 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FXNQ16595 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FXNQ16595 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FXNQ16595 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FXNQ16595 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FXNQ16595 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FXNQ16595 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FXNQ16595 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FXNQ16595 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FXNQ16595 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FXNQ16595 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FXNQ16595 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FXNQ16595 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FXNQ16595 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FXNQ16595 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FXNQ16595 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FXNQ16595 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FXNQ16595 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FXNQ16595 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FXNQ16595 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FXNQ16595 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FXNQ16595 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FXNQ16595 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FXNQ16595 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FXNQ16595 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FXNQ16595 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FXNQ16595 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FXNQ16595 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FXNQ16595 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FXNQ16595 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FXNQ16595 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FXNQ16595 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FXNQ16595 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
FXNQ16595 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FXNQ16595 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FXNQ16595 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FXNQ16595 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
FXNQ16595 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FXNQ16595 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FXNQ16595 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FXNQ16595 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FXNQ16595 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FXNQ16595 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FXNQ16595 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FXNQ16595 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FXNQ16595 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FXNQ16595 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FXNQ16595 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FXNQ16595 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
FXNQ16595 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FXNQ16595 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FXNQ16595 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FXNQ16595 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FXNQ16595 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FXNQ16595 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FXNQ16595 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FXNQ16595 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FXNQ16595 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FXNQ16595 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FXNQ16595 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
FXNQ16595 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FXNQ16595 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FXNQ16595 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FXNQ16595 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FXNQ16595 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FXNQ16595 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FXNQ16595 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FXNQ16595 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FXNQ16595 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FXNQ16595 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FXNQ16595 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
FXNQ16595 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FXNQ16595 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FXNQ16595 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FXNQ16595 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FXNQ16595 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FXNQ16595 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FXNQ16595 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FXNQ16595 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FXNQ16595 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FXNQ16595 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FXNQ16595 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FXNQ16595 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
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