Protein–RNA interactions for Protein: Q15435

PPP1R7, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 7, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R7Q15435 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PPP1R7Q15435 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PPP1R7Q15435 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PPP1R7Q15435 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PPP1R7Q15435 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PPP1R7Q15435 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PPP1R7Q15435 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PPP1R7Q15435 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PPP1R7Q15435 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PPP1R7Q15435 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PPP1R7Q15435 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PPP1R7Q15435 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PPP1R7Q15435 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PPP1R7Q15435 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PPP1R7Q15435 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PPP1R7Q15435 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PPP1R7Q15435 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PPP1R7Q15435 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
PPP1R7Q15435 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
PPP1R7Q15435 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PPP1R7Q15435 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PPP1R7Q15435 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.54■■■□□ 2
PPP1R7Q15435 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PPP1R7Q15435 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PPP1R7Q15435 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PPP1R7Q15435 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.53■■■□□ 2
PPP1R7Q15435 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PPP1R7Q15435 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PPP1R7Q15435 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PPP1R7Q15435 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PPP1R7Q15435 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PPP1R7Q15435 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PPP1R7Q15435 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PPP1R7Q15435 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PPP1R7Q15435 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PPP1R7Q15435 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PPP1R7Q15435 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PPP1R7Q15435 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PPP1R7Q15435 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PPP1R7Q15435 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PPP1R7Q15435 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PPP1R7Q15435 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PPP1R7Q15435 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PPP1R7Q15435 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PPP1R7Q15435 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PPP1R7Q15435 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PPP1R7Q15435 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PPP1R7Q15435 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PPP1R7Q15435 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PPP1R7Q15435 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PPP1R7Q15435 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PPP1R7Q15435 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PPP1R7Q15435 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PPP1R7Q15435 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PPP1R7Q15435 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PPP1R7Q15435 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PPP1R7Q15435 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PPP1R7Q15435 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PPP1R7Q15435 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PPP1R7Q15435 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PPP1R7Q15435 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PPP1R7Q15435 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PPP1R7Q15435 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PPP1R7Q15435 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PPP1R7Q15435 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PPP1R7Q15435 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
PPP1R7Q15435 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PPP1R7Q15435 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PPP1R7Q15435 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PPP1R7Q15435 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PPP1R7Q15435 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PPP1R7Q15435 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PPP1R7Q15435 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PPP1R7Q15435 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PPP1R7Q15435 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PPP1R7Q15435 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PPP1R7Q15435 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PPP1R7Q15435 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PPP1R7Q15435 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PPP1R7Q15435 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PPP1R7Q15435 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PPP1R7Q15435 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
PPP1R7Q15435 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PPP1R7Q15435 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
PPP1R7Q15435 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PPP1R7Q15435 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PPP1R7Q15435 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PPP1R7Q15435 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PPP1R7Q15435 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PPP1R7Q15435 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PPP1R7Q15435 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PPP1R7Q15435 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PPP1R7Q15435 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PPP1R7Q15435 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PPP1R7Q15435 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PPP1R7Q15435 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PPP1R7Q15435 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PPP1R7Q15435 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PPP1R7Q15435 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PPP1R7Q15435 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.9 ms