Protein–RNA interactions for Protein: Q15120

PDK3, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 3, mitochondrial, humanhuman

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK3Q15120 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDK3Q15120 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PDK3Q15120 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDK3Q15120 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDK3Q15120 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDK3Q15120 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDK3Q15120 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDK3Q15120 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDK3Q15120 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDK3Q15120 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDK3Q15120 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDK3Q15120 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDK3Q15120 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDK3Q15120 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDK3Q15120 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDK3Q15120 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDK3Q15120 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDK3Q15120 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDK3Q15120 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDK3Q15120 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDK3Q15120 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDK3Q15120 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDK3Q15120 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDK3Q15120 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDK3Q15120 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDK3Q15120 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDK3Q15120 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDK3Q15120 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDK3Q15120 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDK3Q15120 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDK3Q15120 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDK3Q15120 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDK3Q15120 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDK3Q15120 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PDK3Q15120 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDK3Q15120 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDK3Q15120 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDK3Q15120 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDK3Q15120 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDK3Q15120 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDK3Q15120 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDK3Q15120 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDK3Q15120 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDK3Q15120 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PDK3Q15120 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDK3Q15120 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDK3Q15120 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDK3Q15120 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDK3Q15120 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDK3Q15120 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDK3Q15120 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDK3Q15120 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDK3Q15120 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDK3Q15120 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDK3Q15120 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDK3Q15120 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDK3Q15120 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDK3Q15120 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDK3Q15120 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDK3Q15120 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDK3Q15120 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PDK3Q15120 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDK3Q15120 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDK3Q15120 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDK3Q15120 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDK3Q15120 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDK3Q15120 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDK3Q15120 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDK3Q15120 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDK3Q15120 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDK3Q15120 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDK3Q15120 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDK3Q15120 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDK3Q15120 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDK3Q15120 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDK3Q15120 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDK3Q15120 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDK3Q15120 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDK3Q15120 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDK3Q15120 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDK3Q15120 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDK3Q15120 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDK3Q15120 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDK3Q15120 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDK3Q15120 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDK3Q15120 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDK3Q15120 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDK3Q15120 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDK3Q15120 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PDK3Q15120 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDK3Q15120 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDK3Q15120 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDK3Q15120 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDK3Q15120 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PDK3Q15120 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PDK3Q15120 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDK3Q15120 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDK3Q15120 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDK3Q15120 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDK3Q15120 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
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