Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CACNA1CQ13936 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CACNA1CQ13936 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CACNA1CQ13936 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CACNA1CQ13936 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CACNA1CQ13936 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CACNA1CQ13936 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CACNA1CQ13936 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CACNA1CQ13936 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CACNA1CQ13936 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CACNA1CQ13936 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CACNA1CQ13936 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CACNA1CQ13936 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CACNA1CQ13936 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CACNA1CQ13936 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CACNA1CQ13936 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CACNA1CQ13936 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CACNA1CQ13936 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CACNA1CQ13936 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CACNA1CQ13936 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CACNA1CQ13936 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CACNA1CQ13936 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CACNA1CQ13936 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CACNA1CQ13936 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CACNA1CQ13936 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CACNA1CQ13936 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CACNA1CQ13936 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CACNA1CQ13936 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CACNA1CQ13936 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CACNA1CQ13936 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CACNA1CQ13936 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CACNA1CQ13936 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CACNA1CQ13936 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CACNA1CQ13936 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CACNA1CQ13936 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CACNA1CQ13936 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CACNA1CQ13936 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CACNA1CQ13936 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CACNA1CQ13936 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CACNA1CQ13936 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CACNA1CQ13936 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CACNA1CQ13936 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CACNA1CQ13936 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CACNA1CQ13936 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CACNA1CQ13936 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CACNA1CQ13936 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CACNA1CQ13936 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CACNA1CQ13936 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CACNA1CQ13936 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CACNA1CQ13936 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CACNA1CQ13936 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CACNA1CQ13936 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CACNA1CQ13936 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CACNA1CQ13936 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CACNA1CQ13936 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CACNA1CQ13936 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CACNA1CQ13936 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CACNA1CQ13936 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CACNA1CQ13936 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CACNA1CQ13936 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CACNA1CQ13936 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CACNA1CQ13936 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CACNA1CQ13936 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CACNA1CQ13936 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CACNA1CQ13936 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CACNA1CQ13936 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
CACNA1CQ13936 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CACNA1CQ13936 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CACNA1CQ13936 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CACNA1CQ13936 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CACNA1CQ13936 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CACNA1CQ13936 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CACNA1CQ13936 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CACNA1CQ13936 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CACNA1CQ13936 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CACNA1CQ13936 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CACNA1CQ13936 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CACNA1CQ13936 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CACNA1CQ13936 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CACNA1CQ13936 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CACNA1CQ13936 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CACNA1CQ13936 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CACNA1CQ13936 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CACNA1CQ13936 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CACNA1CQ13936 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CACNA1CQ13936 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CACNA1CQ13936 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CACNA1CQ13936 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CACNA1CQ13936 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CACNA1CQ13936 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CACNA1CQ13936 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CACNA1CQ13936 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CACNA1CQ13936 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CACNA1CQ13936 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CACNA1CQ13936 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CACNA1CQ13936 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CACNA1CQ13936 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CACNA1CQ13936 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CACNA1CQ13936 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CACNA1CQ13936 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
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