Protein–RNA interactions for Protein: Q13011

ECH1, Delta(3,5)-Delta(2,4)-dienoyl-CoA isomerase, mitochondrial, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECH1Q13011 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ECH1Q13011 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ECH1Q13011 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ECH1Q13011 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ECH1Q13011 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ECH1Q13011 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ECH1Q13011 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ECH1Q13011 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ECH1Q13011 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ECH1Q13011 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ECH1Q13011 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ECH1Q13011 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ECH1Q13011 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ECH1Q13011 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ECH1Q13011 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ECH1Q13011 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ECH1Q13011 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ECH1Q13011 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ECH1Q13011 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ECH1Q13011 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ECH1Q13011 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ECH1Q13011 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ECH1Q13011 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ECH1Q13011 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ECH1Q13011 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ECH1Q13011 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ECH1Q13011 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ECH1Q13011 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ECH1Q13011 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ECH1Q13011 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ECH1Q13011 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ECH1Q13011 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ECH1Q13011 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ECH1Q13011 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ECH1Q13011 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ECH1Q13011 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ECH1Q13011 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ECH1Q13011 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ECH1Q13011 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ECH1Q13011 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ECH1Q13011 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ECH1Q13011 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ECH1Q13011 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ECH1Q13011 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ECH1Q13011 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ECH1Q13011 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ECH1Q13011 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ECH1Q13011 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ECH1Q13011 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ECH1Q13011 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ECH1Q13011 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ECH1Q13011 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ECH1Q13011 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ECH1Q13011 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ECH1Q13011 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ECH1Q13011 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ECH1Q13011 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ECH1Q13011 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ECH1Q13011 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ECH1Q13011 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ECH1Q13011 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ECH1Q13011 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ECH1Q13011 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ECH1Q13011 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ECH1Q13011 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ECH1Q13011 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ECH1Q13011 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ECH1Q13011 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ECH1Q13011 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ECH1Q13011 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ECH1Q13011 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ECH1Q13011 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ECH1Q13011 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ECH1Q13011 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ECH1Q13011 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ECH1Q13011 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ECH1Q13011 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ECH1Q13011 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ECH1Q13011 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ECH1Q13011 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ECH1Q13011 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ECH1Q13011 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ECH1Q13011 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ECH1Q13011 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ECH1Q13011 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ECH1Q13011 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ECH1Q13011 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ECH1Q13011 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ECH1Q13011 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ECH1Q13011 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ECH1Q13011 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ECH1Q13011 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ECH1Q13011 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ECH1Q13011 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ECH1Q13011 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ECH1Q13011 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ECH1Q13011 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ECH1Q13011 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ECH1Q13011 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ECH1Q13011 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
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