Protein–RNA interactions for Protein: Q12872

SFSWAP, Splicing factor, suppressor of white-apricot homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 951 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFSWAPQ12872 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SFSWAPQ12872 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SFSWAPQ12872 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SFSWAPQ12872 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SFSWAPQ12872 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SFSWAPQ12872 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SFSWAPQ12872 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SFSWAPQ12872 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
SFSWAPQ12872 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SFSWAPQ12872 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SFSWAPQ12872 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
SFSWAPQ12872 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SFSWAPQ12872 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SFSWAPQ12872 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
SFSWAPQ12872 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SFSWAPQ12872 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SFSWAPQ12872 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SFSWAPQ12872 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SFSWAPQ12872 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SFSWAPQ12872 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SFSWAPQ12872 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SFSWAPQ12872 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SFSWAPQ12872 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
SFSWAPQ12872 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SFSWAPQ12872 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SFSWAPQ12872 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SFSWAPQ12872 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SFSWAPQ12872 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SFSWAPQ12872 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SFSWAPQ12872 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SFSWAPQ12872 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SFSWAPQ12872 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SFSWAPQ12872 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SFSWAPQ12872 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SFSWAPQ12872 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SFSWAPQ12872 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SFSWAPQ12872 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SFSWAPQ12872 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SFSWAPQ12872 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
SFSWAPQ12872 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SFSWAPQ12872 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SFSWAPQ12872 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SFSWAPQ12872 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SFSWAPQ12872 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SFSWAPQ12872 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
SFSWAPQ12872 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SFSWAPQ12872 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SFSWAPQ12872 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SFSWAPQ12872 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SFSWAPQ12872 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SFSWAPQ12872 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
SFSWAPQ12872 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SFSWAPQ12872 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SFSWAPQ12872 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SFSWAPQ12872 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SFSWAPQ12872 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SFSWAPQ12872 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SFSWAPQ12872 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SFSWAPQ12872 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SFSWAPQ12872 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
SFSWAPQ12872 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
SFSWAPQ12872 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SFSWAPQ12872 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SFSWAPQ12872 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SFSWAPQ12872 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SFSWAPQ12872 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SFSWAPQ12872 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SFSWAPQ12872 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SFSWAPQ12872 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SFSWAPQ12872 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
SFSWAPQ12872 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SFSWAPQ12872 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SFSWAPQ12872 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SFSWAPQ12872 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SFSWAPQ12872 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SFSWAPQ12872 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SFSWAPQ12872 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SFSWAPQ12872 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SFSWAPQ12872 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SFSWAPQ12872 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SFSWAPQ12872 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SFSWAPQ12872 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SFSWAPQ12872 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SFSWAPQ12872 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SFSWAPQ12872 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SFSWAPQ12872 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SFSWAPQ12872 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SFSWAPQ12872 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SFSWAPQ12872 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SFSWAPQ12872 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SFSWAPQ12872 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SFSWAPQ12872 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SFSWAPQ12872 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SFSWAPQ12872 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SFSWAPQ12872 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SFSWAPQ12872 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SFSWAPQ12872 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SFSWAPQ12872 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SFSWAPQ12872 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SFSWAPQ12872 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
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