Protein–RNA interactions for Protein: Q07065

CKAP4, Cytoskeleton-associated protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP4Q07065 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CKAP4Q07065 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CKAP4Q07065 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CKAP4Q07065 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CKAP4Q07065 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CKAP4Q07065 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CKAP4Q07065 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CKAP4Q07065 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CKAP4Q07065 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CKAP4Q07065 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CKAP4Q07065 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
CKAP4Q07065 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CKAP4Q07065 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CKAP4Q07065 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CKAP4Q07065 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CKAP4Q07065 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CKAP4Q07065 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CKAP4Q07065 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CKAP4Q07065 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CKAP4Q07065 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CKAP4Q07065 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CKAP4Q07065 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CKAP4Q07065 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CKAP4Q07065 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CKAP4Q07065 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CKAP4Q07065 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CKAP4Q07065 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CKAP4Q07065 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
CKAP4Q07065 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
CKAP4Q07065 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CKAP4Q07065 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CKAP4Q07065 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CKAP4Q07065 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CKAP4Q07065 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CKAP4Q07065 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CKAP4Q07065 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CKAP4Q07065 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CKAP4Q07065 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CKAP4Q07065 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CKAP4Q07065 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CKAP4Q07065 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CKAP4Q07065 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CKAP4Q07065 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CKAP4Q07065 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CKAP4Q07065 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CKAP4Q07065 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CKAP4Q07065 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CKAP4Q07065 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CKAP4Q07065 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CKAP4Q07065 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CKAP4Q07065 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CKAP4Q07065 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CKAP4Q07065 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CKAP4Q07065 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CKAP4Q07065 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CKAP4Q07065 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CKAP4Q07065 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CKAP4Q07065 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CKAP4Q07065 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CKAP4Q07065 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CKAP4Q07065 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CKAP4Q07065 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CKAP4Q07065 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CKAP4Q07065 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CKAP4Q07065 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CKAP4Q07065 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CKAP4Q07065 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CKAP4Q07065 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CKAP4Q07065 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CKAP4Q07065 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CKAP4Q07065 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CKAP4Q07065 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CKAP4Q07065 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CKAP4Q07065 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CKAP4Q07065 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CKAP4Q07065 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CKAP4Q07065 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CKAP4Q07065 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
CKAP4Q07065 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CKAP4Q07065 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CKAP4Q07065 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
CKAP4Q07065 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CKAP4Q07065 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CKAP4Q07065 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CKAP4Q07065 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
CKAP4Q07065 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CKAP4Q07065 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CKAP4Q07065 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CKAP4Q07065 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
CKAP4Q07065 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CKAP4Q07065 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CKAP4Q07065 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CKAP4Q07065 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CKAP4Q07065 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
CKAP4Q07065 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CKAP4Q07065 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CKAP4Q07065 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CKAP4Q07065 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CKAP4Q07065 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CKAP4Q07065 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms