Protein–RNA interactions for Protein: Q02577

NHLH2, Helix-loop-helix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2Q02577 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NHLH2Q02577 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NHLH2Q02577 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NHLH2Q02577 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NHLH2Q02577 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NHLH2Q02577 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NHLH2Q02577 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NHLH2Q02577 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NHLH2Q02577 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NHLH2Q02577 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NHLH2Q02577 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NHLH2Q02577 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NHLH2Q02577 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NHLH2Q02577 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NHLH2Q02577 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NHLH2Q02577 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NHLH2Q02577 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NHLH2Q02577 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NHLH2Q02577 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NHLH2Q02577 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NHLH2Q02577 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NHLH2Q02577 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NHLH2Q02577 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NHLH2Q02577 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NHLH2Q02577 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NHLH2Q02577 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NHLH2Q02577 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NHLH2Q02577 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NHLH2Q02577 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NHLH2Q02577 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NHLH2Q02577 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NHLH2Q02577 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NHLH2Q02577 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NHLH2Q02577 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NHLH2Q02577 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NHLH2Q02577 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NHLH2Q02577 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NHLH2Q02577 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NHLH2Q02577 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NHLH2Q02577 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NHLH2Q02577 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NHLH2Q02577 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NHLH2Q02577 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NHLH2Q02577 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NHLH2Q02577 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NHLH2Q02577 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NHLH2Q02577 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
NHLH2Q02577 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NHLH2Q02577 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NHLH2Q02577 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NHLH2Q02577 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NHLH2Q02577 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NHLH2Q02577 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NHLH2Q02577 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NHLH2Q02577 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NHLH2Q02577 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NHLH2Q02577 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NHLH2Q02577 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NHLH2Q02577 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NHLH2Q02577 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NHLH2Q02577 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NHLH2Q02577 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NHLH2Q02577 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NHLH2Q02577 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NHLH2Q02577 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NHLH2Q02577 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NHLH2Q02577 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NHLH2Q02577 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NHLH2Q02577 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NHLH2Q02577 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NHLH2Q02577 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NHLH2Q02577 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NHLH2Q02577 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NHLH2Q02577 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NHLH2Q02577 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NHLH2Q02577 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NHLH2Q02577 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NHLH2Q02577 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NHLH2Q02577 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NHLH2Q02577 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NHLH2Q02577 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NHLH2Q02577 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NHLH2Q02577 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NHLH2Q02577 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NHLH2Q02577 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NHLH2Q02577 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NHLH2Q02577 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NHLH2Q02577 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
NHLH2Q02577 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NHLH2Q02577 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NHLH2Q02577 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NHLH2Q02577 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NHLH2Q02577 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NHLH2Q02577 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NHLH2Q02577 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NHLH2Q02577 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NHLH2Q02577 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NHLH2Q02577 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NHLH2Q02577 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NHLH2Q02577 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms