Protein–RNA interactions for Protein: Q02548

PAX5, Paired box protein Pax-5, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX5Q02548 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PAX5Q02548 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PAX5Q02548 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PAX5Q02548 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PAX5Q02548 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PAX5Q02548 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PAX5Q02548 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PAX5Q02548 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PAX5Q02548 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PAX5Q02548 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PAX5Q02548 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PAX5Q02548 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PAX5Q02548 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PAX5Q02548 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PAX5Q02548 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PAX5Q02548 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PAX5Q02548 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PAX5Q02548 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PAX5Q02548 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PAX5Q02548 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PAX5Q02548 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PAX5Q02548 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PAX5Q02548 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PAX5Q02548 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PAX5Q02548 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PAX5Q02548 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PAX5Q02548 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PAX5Q02548 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PAX5Q02548 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PAX5Q02548 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PAX5Q02548 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PAX5Q02548 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PAX5Q02548 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PAX5Q02548 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PAX5Q02548 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PAX5Q02548 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PAX5Q02548 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PAX5Q02548 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PAX5Q02548 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PAX5Q02548 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PAX5Q02548 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PAX5Q02548 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PAX5Q02548 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PAX5Q02548 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PAX5Q02548 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PAX5Q02548 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PAX5Q02548 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PAX5Q02548 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PAX5Q02548 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PAX5Q02548 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PAX5Q02548 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PAX5Q02548 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PAX5Q02548 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PAX5Q02548 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PAX5Q02548 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PAX5Q02548 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PAX5Q02548 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PAX5Q02548 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
PAX5Q02548 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PAX5Q02548 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PAX5Q02548 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PAX5Q02548 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PAX5Q02548 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PAX5Q02548 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PAX5Q02548 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PAX5Q02548 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PAX5Q02548 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PAX5Q02548 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PAX5Q02548 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PAX5Q02548 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PAX5Q02548 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PAX5Q02548 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PAX5Q02548 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PAX5Q02548 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PAX5Q02548 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PAX5Q02548 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PAX5Q02548 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PAX5Q02548 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PAX5Q02548 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PAX5Q02548 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PAX5Q02548 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PAX5Q02548 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PAX5Q02548 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PAX5Q02548 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PAX5Q02548 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PAX5Q02548 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PAX5Q02548 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PAX5Q02548 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PAX5Q02548 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PAX5Q02548 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PAX5Q02548 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PAX5Q02548 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PAX5Q02548 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PAX5Q02548 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PAX5Q02548 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PAX5Q02548 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PAX5Q02548 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PAX5Q02548 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PAX5Q02548 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PAX5Q02548 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms