Protein–RNA interactions for Protein: Q01064

PDE1B, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, humanhuman

Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE1BQ01064 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PDE1BQ01064 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PDE1BQ01064 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PDE1BQ01064 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PDE1BQ01064 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PDE1BQ01064 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
PDE1BQ01064 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PDE1BQ01064 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PDE1BQ01064 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PDE1BQ01064 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PDE1BQ01064 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PDE1BQ01064 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PDE1BQ01064 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PDE1BQ01064 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PDE1BQ01064 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PDE1BQ01064 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PDE1BQ01064 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PDE1BQ01064 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PDE1BQ01064 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PDE1BQ01064 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PDE1BQ01064 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PDE1BQ01064 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PDE1BQ01064 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PDE1BQ01064 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PDE1BQ01064 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PDE1BQ01064 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
PDE1BQ01064 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PDE1BQ01064 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PDE1BQ01064 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PDE1BQ01064 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PDE1BQ01064 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
PDE1BQ01064 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PDE1BQ01064 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PDE1BQ01064 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PDE1BQ01064 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PDE1BQ01064 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PDE1BQ01064 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PDE1BQ01064 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PDE1BQ01064 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PDE1BQ01064 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PDE1BQ01064 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PDE1BQ01064 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PDE1BQ01064 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PDE1BQ01064 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PDE1BQ01064 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PDE1BQ01064 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PDE1BQ01064 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PDE1BQ01064 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PDE1BQ01064 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PDE1BQ01064 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PDE1BQ01064 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PDE1BQ01064 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
PDE1BQ01064 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PDE1BQ01064 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PDE1BQ01064 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PDE1BQ01064 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PDE1BQ01064 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PDE1BQ01064 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PDE1BQ01064 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PDE1BQ01064 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PDE1BQ01064 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PDE1BQ01064 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
PDE1BQ01064 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PDE1BQ01064 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PDE1BQ01064 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PDE1BQ01064 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PDE1BQ01064 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PDE1BQ01064 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PDE1BQ01064 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PDE1BQ01064 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PDE1BQ01064 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
PDE1BQ01064 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDE1BQ01064 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
PDE1BQ01064 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PDE1BQ01064 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PDE1BQ01064 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PDE1BQ01064 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PDE1BQ01064 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PDE1BQ01064 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PDE1BQ01064 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PDE1BQ01064 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PDE1BQ01064 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PDE1BQ01064 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PDE1BQ01064 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PDE1BQ01064 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PDE1BQ01064 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PDE1BQ01064 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PDE1BQ01064 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PDE1BQ01064 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PDE1BQ01064 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PDE1BQ01064 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PDE1BQ01064 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PDE1BQ01064 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PDE1BQ01064 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PDE1BQ01064 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PDE1BQ01064 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PDE1BQ01064 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PDE1BQ01064 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PDE1BQ01064 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PDE1BQ01064 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms