Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HERVK_113P63121 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HERVK_113P63121 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HERVK_113P63121 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HERVK_113P63121 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HERVK_113P63121 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HERVK_113P63121 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HERVK_113P63121 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HERVK_113P63121 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HERVK_113P63121 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HERVK_113P63121 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HERVK_113P63121 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HERVK_113P63121 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HERVK_113P63121 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HERVK_113P63121 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HERVK_113P63121 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HERVK_113P63121 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HERVK_113P63121 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HERVK_113P63121 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HERVK_113P63121 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HERVK_113P63121 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HERVK_113P63121 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HERVK_113P63121 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HERVK_113P63121 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HERVK_113P63121 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HERVK_113P63121 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HERVK_113P63121 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HERVK_113P63121 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERVK_113P63121 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERVK_113P63121 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERVK_113P63121 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERVK_113P63121 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERVK_113P63121 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERVK_113P63121 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERVK_113P63121 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERVK_113P63121 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERVK_113P63121 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HERVK_113P63121 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
HERVK_113P63121 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HERVK_113P63121 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
HERVK_113P63121 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HERVK_113P63121 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HERVK_113P63121 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HERVK_113P63121 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HERVK_113P63121 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HERVK_113P63121 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HERVK_113P63121 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HERVK_113P63121 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HERVK_113P63121 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HERVK_113P63121 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HERVK_113P63121 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
HERVK_113P63121 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
HERVK_113P63121 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HERVK_113P63121 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HERVK_113P63121 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HERVK_113P63121 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HERVK_113P63121 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HERVK_113P63121 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HERVK_113P63121 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HERVK_113P63121 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HERVK_113P63121 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HERVK_113P63121 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HERVK_113P63121 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HERVK_113P63121 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HERVK_113P63121 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HERVK_113P63121 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HERVK_113P63121 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HERVK_113P63121 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HERVK_113P63121 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HERVK_113P63121 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HERVK_113P63121 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HERVK_113P63121 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HERVK_113P63121 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HERVK_113P63121 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HERVK_113P63121 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HERVK_113P63121 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HERVK_113P63121 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HERVK_113P63121 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HERVK_113P63121 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HERVK_113P63121 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HERVK_113P63121 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HERVK_113P63121 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HERVK_113P63121 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HERVK_113P63121 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HERVK_113P63121 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HERVK_113P63121 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HERVK_113P63121 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HERVK_113P63121 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HERVK_113P63121 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERVK_113P63121 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERVK_113P63121 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERVK_113P63121 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERVK_113P63121 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERVK_113P63121 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERVK_113P63121 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERVK_113P63121 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERVK_113P63121 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HERVK_113P63121 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HERVK_113P63121 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HERVK_113P63121 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.8 ms