Protein–RNA interactions for Protein: P51003

PAPOLA, Poly(A) polymerase alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPOLAP51003 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PAPOLAP51003 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PAPOLAP51003 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PAPOLAP51003 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PAPOLAP51003 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PAPOLAP51003 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
PAPOLAP51003 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PAPOLAP51003 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PAPOLAP51003 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PAPOLAP51003 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PAPOLAP51003 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PAPOLAP51003 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PAPOLAP51003 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PAPOLAP51003 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PAPOLAP51003 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PAPOLAP51003 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PAPOLAP51003 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PAPOLAP51003 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PAPOLAP51003 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PAPOLAP51003 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PAPOLAP51003 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PAPOLAP51003 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PAPOLAP51003 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PAPOLAP51003 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PAPOLAP51003 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PAPOLAP51003 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PAPOLAP51003 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PAPOLAP51003 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PAPOLAP51003 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PAPOLAP51003 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PAPOLAP51003 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PAPOLAP51003 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
PAPOLAP51003 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
PAPOLAP51003 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PAPOLAP51003 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PAPOLAP51003 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PAPOLAP51003 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PAPOLAP51003 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PAPOLAP51003 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PAPOLAP51003 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PAPOLAP51003 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PAPOLAP51003 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PAPOLAP51003 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PAPOLAP51003 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
PAPOLAP51003 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PAPOLAP51003 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PAPOLAP51003 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PAPOLAP51003 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PAPOLAP51003 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PAPOLAP51003 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PAPOLAP51003 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PAPOLAP51003 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PAPOLAP51003 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PAPOLAP51003 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PAPOLAP51003 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PAPOLAP51003 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PAPOLAP51003 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PAPOLAP51003 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PAPOLAP51003 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PAPOLAP51003 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
PAPOLAP51003 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PAPOLAP51003 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PAPOLAP51003 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PAPOLAP51003 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PAPOLAP51003 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
PAPOLAP51003 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PAPOLAP51003 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PAPOLAP51003 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PAPOLAP51003 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PAPOLAP51003 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PAPOLAP51003 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PAPOLAP51003 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PAPOLAP51003 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PAPOLAP51003 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PAPOLAP51003 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
PAPOLAP51003 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PAPOLAP51003 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PAPOLAP51003 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PAPOLAP51003 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PAPOLAP51003 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PAPOLAP51003 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PAPOLAP51003 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PAPOLAP51003 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
PAPOLAP51003 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
PAPOLAP51003 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PAPOLAP51003 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PAPOLAP51003 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PAPOLAP51003 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PAPOLAP51003 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PAPOLAP51003 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
PAPOLAP51003 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PAPOLAP51003 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
PAPOLAP51003 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PAPOLAP51003 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PAPOLAP51003 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PAPOLAP51003 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PAPOLAP51003 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
PAPOLAP51003 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PAPOLAP51003 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
PAPOLAP51003 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms