Protein–RNA interactions for Protein: P48995

TRPC1, Short transient receptor potential channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1P48995 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRPC1P48995 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRPC1P48995 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRPC1P48995 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRPC1P48995 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRPC1P48995 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TRPC1P48995 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRPC1P48995 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRPC1P48995 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRPC1P48995 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRPC1P48995 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRPC1P48995 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRPC1P48995 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
TRPC1P48995 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRPC1P48995 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRPC1P48995 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRPC1P48995 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRPC1P48995 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TRPC1P48995 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRPC1P48995 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRPC1P48995 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRPC1P48995 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRPC1P48995 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRPC1P48995 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRPC1P48995 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRPC1P48995 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRPC1P48995 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRPC1P48995 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRPC1P48995 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRPC1P48995 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TRPC1P48995 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRPC1P48995 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRPC1P48995 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRPC1P48995 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRPC1P48995 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRPC1P48995 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRPC1P48995 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRPC1P48995 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
TRPC1P48995 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRPC1P48995 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRPC1P48995 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRPC1P48995 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRPC1P48995 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRPC1P48995 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRPC1P48995 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRPC1P48995 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRPC1P48995 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRPC1P48995 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRPC1P48995 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRPC1P48995 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TRPC1P48995 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRPC1P48995 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRPC1P48995 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TRPC1P48995 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRPC1P48995 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRPC1P48995 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRPC1P48995 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRPC1P48995 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRPC1P48995 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRPC1P48995 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRPC1P48995 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRPC1P48995 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRPC1P48995 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRPC1P48995 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRPC1P48995 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRPC1P48995 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRPC1P48995 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRPC1P48995 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRPC1P48995 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRPC1P48995 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRPC1P48995 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRPC1P48995 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRPC1P48995 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRPC1P48995 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRPC1P48995 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRPC1P48995 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRPC1P48995 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TRPC1P48995 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRPC1P48995 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRPC1P48995 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRPC1P48995 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRPC1P48995 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
TRPC1P48995 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRPC1P48995 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRPC1P48995 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRPC1P48995 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRPC1P48995 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRPC1P48995 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRPC1P48995 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRPC1P48995 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRPC1P48995 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRPC1P48995 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRPC1P48995 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
TRPC1P48995 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRPC1P48995 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRPC1P48995 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRPC1P48995 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRPC1P48995 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRPC1P48995 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRPC1P48995 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms