Protein–RNA interactions for Protein: P38571

LIPA, Lysosomal acid lipase/cholesteryl ester hydrolase, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIPAP38571 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LIPAP38571 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LIPAP38571 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LIPAP38571 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LIPAP38571 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LIPAP38571 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LIPAP38571 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LIPAP38571 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LIPAP38571 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LIPAP38571 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LIPAP38571 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LIPAP38571 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LIPAP38571 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LIPAP38571 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LIPAP38571 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LIPAP38571 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LIPAP38571 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LIPAP38571 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LIPAP38571 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LIPAP38571 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LIPAP38571 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LIPAP38571 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LIPAP38571 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
LIPAP38571 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LIPAP38571 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LIPAP38571 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LIPAP38571 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LIPAP38571 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LIPAP38571 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LIPAP38571 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LIPAP38571 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LIPAP38571 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LIPAP38571 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LIPAP38571 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LIPAP38571 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LIPAP38571 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LIPAP38571 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LIPAP38571 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LIPAP38571 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LIPAP38571 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LIPAP38571 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LIPAP38571 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LIPAP38571 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LIPAP38571 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LIPAP38571 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LIPAP38571 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LIPAP38571 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LIPAP38571 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LIPAP38571 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
LIPAP38571 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LIPAP38571 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LIPAP38571 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LIPAP38571 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LIPAP38571 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LIPAP38571 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LIPAP38571 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LIPAP38571 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LIPAP38571 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LIPAP38571 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LIPAP38571 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LIPAP38571 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LIPAP38571 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LIPAP38571 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
LIPAP38571 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LIPAP38571 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LIPAP38571 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LIPAP38571 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LIPAP38571 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LIPAP38571 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LIPAP38571 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LIPAP38571 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LIPAP38571 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LIPAP38571 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LIPAP38571 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LIPAP38571 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LIPAP38571 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LIPAP38571 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LIPAP38571 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LIPAP38571 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LIPAP38571 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LIPAP38571 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LIPAP38571 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LIPAP38571 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LIPAP38571 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LIPAP38571 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LIPAP38571 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LIPAP38571 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LIPAP38571 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LIPAP38571 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LIPAP38571 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LIPAP38571 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LIPAP38571 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LIPAP38571 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LIPAP38571 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LIPAP38571 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LIPAP38571 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LIPAP38571 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LIPAP38571 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LIPAP38571 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LIPAP38571 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms