Protein–RNA interactions for Protein: P30038

ALDH4A1, Delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH4A1P30038 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
ALDH4A1P30038 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ALDH4A1P30038 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ALDH4A1P30038 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ALDH4A1P30038 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ALDH4A1P30038 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ALDH4A1P30038 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ALDH4A1P30038 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ALDH4A1P30038 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ALDH4A1P30038 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ALDH4A1P30038 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ALDH4A1P30038 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ALDH4A1P30038 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ALDH4A1P30038 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ALDH4A1P30038 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ALDH4A1P30038 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ALDH4A1P30038 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ALDH4A1P30038 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ALDH4A1P30038 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ALDH4A1P30038 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ALDH4A1P30038 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ALDH4A1P30038 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ALDH4A1P30038 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ALDH4A1P30038 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ALDH4A1P30038 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ALDH4A1P30038 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ALDH4A1P30038 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ALDH4A1P30038 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ALDH4A1P30038 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ALDH4A1P30038 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ALDH4A1P30038 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ALDH4A1P30038 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ALDH4A1P30038 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ALDH4A1P30038 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ALDH4A1P30038 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ALDH4A1P30038 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ALDH4A1P30038 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
ALDH4A1P30038 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ALDH4A1P30038 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ALDH4A1P30038 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ALDH4A1P30038 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ALDH4A1P30038 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ALDH4A1P30038 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
ALDH4A1P30038 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ALDH4A1P30038 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ALDH4A1P30038 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ALDH4A1P30038 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ALDH4A1P30038 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.75
ALDH4A1P30038 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ALDH4A1P30038 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ALDH4A1P30038 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
ALDH4A1P30038 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ALDH4A1P30038 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ALDH4A1P30038 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ALDH4A1P30038 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ALDH4A1P30038 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ALDH4A1P30038 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ALDH4A1P30038 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ALDH4A1P30038 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ALDH4A1P30038 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ALDH4A1P30038 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ALDH4A1P30038 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ALDH4A1P30038 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ALDH4A1P30038 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ALDH4A1P30038 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
ALDH4A1P30038 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ALDH4A1P30038 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ALDH4A1P30038 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ALDH4A1P30038 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ALDH4A1P30038 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ALDH4A1P30038 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ALDH4A1P30038 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ALDH4A1P30038 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ALDH4A1P30038 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ALDH4A1P30038 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
ALDH4A1P30038 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ALDH4A1P30038 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ALDH4A1P30038 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
ALDH4A1P30038 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ALDH4A1P30038 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ALDH4A1P30038 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ALDH4A1P30038 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
ALDH4A1P30038 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ALDH4A1P30038 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ALDH4A1P30038 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ALDH4A1P30038 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ALDH4A1P30038 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ALDH4A1P30038 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ALDH4A1P30038 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ALDH4A1P30038 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ALDH4A1P30038 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ALDH4A1P30038 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ALDH4A1P30038 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ALDH4A1P30038 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ALDH4A1P30038 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ALDH4A1P30038 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ALDH4A1P30038 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ALDH4A1P30038 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ALDH4A1P30038 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ALDH4A1P30038 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms