Protein–RNA interactions for Protein: P22670

RFX1, MHC class II regulatory factor RFX1, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX1P22670 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC29■■■□□ 2.23
RFX1P22670 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RFX1P22670 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RFX1P22670 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
RFX1P22670 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RFX1P22670 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RFX1P22670 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RFX1P22670 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
RFX1P22670 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RFX1P22670 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
RFX1P22670 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RFX1P22670 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RFX1P22670 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
RFX1P22670 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
RFX1P22670 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RFX1P22670 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
RFX1P22670 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RFX1P22670 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
RFX1P22670 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RFX1P22670 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RFX1P22670 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RFX1P22670 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RFX1P22670 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RFX1P22670 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RFX1P22670 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RFX1P22670 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RFX1P22670 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RFX1P22670 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RFX1P22670 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RFX1P22670 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RFX1P22670 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RFX1P22670 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RFX1P22670 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RFX1P22670 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
RFX1P22670 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RFX1P22670 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RFX1P22670 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RFX1P22670 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RFX1P22670 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RFX1P22670 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RFX1P22670 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
RFX1P22670 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RFX1P22670 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RFX1P22670 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RFX1P22670 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RFX1P22670 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RFX1P22670 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RFX1P22670 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RFX1P22670 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RFX1P22670 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RFX1P22670 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RFX1P22670 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RFX1P22670 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RFX1P22670 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RFX1P22670 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RFX1P22670 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RFX1P22670 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RFX1P22670 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RFX1P22670 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RFX1P22670 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
RFX1P22670 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RFX1P22670 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RFX1P22670 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
RFX1P22670 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
RFX1P22670 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RFX1P22670 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RFX1P22670 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RFX1P22670 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RFX1P22670 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RFX1P22670 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
RFX1P22670 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RFX1P22670 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RFX1P22670 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RFX1P22670 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RFX1P22670 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
RFX1P22670 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RFX1P22670 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
RFX1P22670 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RFX1P22670 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RFX1P22670 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RFX1P22670 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RFX1P22670 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RFX1P22670 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RFX1P22670 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RFX1P22670 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RFX1P22670 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RFX1P22670 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RFX1P22670 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RFX1P22670 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
RFX1P22670 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RFX1P22670 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RFX1P22670 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RFX1P22670 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RFX1P22670 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RFX1P22670 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
RFX1P22670 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RFX1P22670 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RFX1P22670 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RFX1P22670 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RFX1P22670 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms