Protein–RNA interactions for Protein: P16333

NCK1, Cytoplasmic protein NCK1, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCK1P16333 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NCK1P16333 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NCK1P16333 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NCK1P16333 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NCK1P16333 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NCK1P16333 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NCK1P16333 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NCK1P16333 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NCK1P16333 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NCK1P16333 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NCK1P16333 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NCK1P16333 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NCK1P16333 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NCK1P16333 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NCK1P16333 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NCK1P16333 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NCK1P16333 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
NCK1P16333 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NCK1P16333 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NCK1P16333 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
NCK1P16333 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NCK1P16333 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NCK1P16333 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NCK1P16333 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NCK1P16333 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NCK1P16333 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NCK1P16333 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
NCK1P16333 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NCK1P16333 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NCK1P16333 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NCK1P16333 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NCK1P16333 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NCK1P16333 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NCK1P16333 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NCK1P16333 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NCK1P16333 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NCK1P16333 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NCK1P16333 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NCK1P16333 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NCK1P16333 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NCK1P16333 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NCK1P16333 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NCK1P16333 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NCK1P16333 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NCK1P16333 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NCK1P16333 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25■■□□□ 1.59
NCK1P16333 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NCK1P16333 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NCK1P16333 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NCK1P16333 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NCK1P16333 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NCK1P16333 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NCK1P16333 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
NCK1P16333 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
NCK1P16333 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NCK1P16333 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NCK1P16333 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NCK1P16333 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NCK1P16333 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
NCK1P16333 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NCK1P16333 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NCK1P16333 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NCK1P16333 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NCK1P16333 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NCK1P16333 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NCK1P16333 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NCK1P16333 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NCK1P16333 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NCK1P16333 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NCK1P16333 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NCK1P16333 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NCK1P16333 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NCK1P16333 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NCK1P16333 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NCK1P16333 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NCK1P16333 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NCK1P16333 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NCK1P16333 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
NCK1P16333 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NCK1P16333 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NCK1P16333 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NCK1P16333 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NCK1P16333 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NCK1P16333 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NCK1P16333 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NCK1P16333 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NCK1P16333 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NCK1P16333 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
NCK1P16333 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NCK1P16333 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NCK1P16333 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NCK1P16333 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NCK1P16333 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NCK1P16333 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NCK1P16333 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NCK1P16333 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NCK1P16333 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NCK1P16333 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NCK1P16333 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NCK1P16333 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.7 ms