Protein–RNA interactions for Protein: P14678

SNRPB, Small nuclear ribonucleoprotein-associated proteins B and B', humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPBP14678 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNRPBP14678 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNRPBP14678 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNRPBP14678 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNRPBP14678 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNRPBP14678 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNRPBP14678 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNRPBP14678 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNRPBP14678 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNRPBP14678 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SNRPBP14678 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNRPBP14678 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNRPBP14678 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNRPBP14678 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNRPBP14678 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNRPBP14678 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNRPBP14678 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNRPBP14678 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNRPBP14678 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNRPBP14678 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNRPBP14678 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNRPBP14678 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNRPBP14678 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNRPBP14678 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNRPBP14678 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNRPBP14678 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNRPBP14678 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNRPBP14678 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNRPBP14678 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNRPBP14678 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNRPBP14678 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
SNRPBP14678 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SNRPBP14678 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNRPBP14678 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNRPBP14678 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNRPBP14678 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNRPBP14678 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNRPBP14678 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNRPBP14678 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNRPBP14678 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNRPBP14678 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNRPBP14678 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNRPBP14678 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNRPBP14678 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNRPBP14678 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNRPBP14678 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNRPBP14678 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNRPBP14678 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNRPBP14678 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNRPBP14678 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNRPBP14678 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNRPBP14678 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SNRPBP14678 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNRPBP14678 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SNRPBP14678 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SNRPBP14678 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNRPBP14678 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNRPBP14678 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNRPBP14678 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNRPBP14678 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNRPBP14678 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNRPBP14678 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SNRPBP14678 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNRPBP14678 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNRPBP14678 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNRPBP14678 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNRPBP14678 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNRPBP14678 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNRPBP14678 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNRPBP14678 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNRPBP14678 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNRPBP14678 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNRPBP14678 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNRPBP14678 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNRPBP14678 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNRPBP14678 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNRPBP14678 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNRPBP14678 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNRPBP14678 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNRPBP14678 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNRPBP14678 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNRPBP14678 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNRPBP14678 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNRPBP14678 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SNRPBP14678 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SNRPBP14678 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNRPBP14678 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNRPBP14678 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNRPBP14678 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SNRPBP14678 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNRPBP14678 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNRPBP14678 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNRPBP14678 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNRPBP14678 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SNRPBP14678 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNRPBP14678 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNRPBP14678 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNRPBP14678 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNRPBP14678 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNRPBP14678 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms