Protein–RNA interactions for Protein: P13164

IFITM1, Interferon-induced transmembrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM1P13164 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IFITM1P13164 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IFITM1P13164 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IFITM1P13164 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IFITM1P13164 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IFITM1P13164 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IFITM1P13164 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFITM1P13164 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFITM1P13164 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IFITM1P13164 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
IFITM1P13164 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
IFITM1P13164 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
IFITM1P13164 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IFITM1P13164 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IFITM1P13164 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IFITM1P13164 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
IFITM1P13164 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC18■□□□□ 0.47
IFITM1P13164 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IFITM1P13164 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IFITM1P13164 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IFITM1P13164 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IFITM1P13164 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IFITM1P13164 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IFITM1P13164 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IFITM1P13164 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
IFITM1P13164 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IFITM1P13164 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IFITM1P13164 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
IFITM1P13164 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
IFITM1P13164 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IFITM1P13164 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IFITM1P13164 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IFITM1P13164 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IFITM1P13164 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IFITM1P13164 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IFITM1P13164 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IFITM1P13164 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
IFITM1P13164 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IFITM1P13164 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
IFITM1P13164 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IFITM1P13164 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IFITM1P13164 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IFITM1P13164 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
IFITM1P13164 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IFITM1P13164 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IFITM1P13164 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IFITM1P13164 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IFITM1P13164 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
IFITM1P13164 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
IFITM1P13164 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
IFITM1P13164 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
IFITM1P13164 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
IFITM1P13164 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
IFITM1P13164 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IFITM1P13164 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
IFITM1P13164 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
IFITM1P13164 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
IFITM1P13164 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IFITM1P13164 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IFITM1P13164 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
IFITM1P13164 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
IFITM1P13164 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IFITM1P13164 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IFITM1P13164 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IFITM1P13164 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
IFITM1P13164 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
IFITM1P13164 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
IFITM1P13164 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
IFITM1P13164 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
IFITM1P13164 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
IFITM1P13164 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
IFITM1P13164 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IFITM1P13164 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IFITM1P13164 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IFITM1P13164 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IFITM1P13164 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
IFITM1P13164 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IFITM1P13164 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
IFITM1P13164 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
IFITM1P13164 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IFITM1P13164 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IFITM1P13164 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IFITM1P13164 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IFITM1P13164 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IFITM1P13164 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IFITM1P13164 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IFITM1P13164 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IFITM1P13164 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
IFITM1P13164 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IFITM1P13164 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IFITM1P13164 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IFITM1P13164 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IFITM1P13164 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IFITM1P13164 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
IFITM1P13164 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
IFITM1P13164 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
IFITM1P13164 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
IFITM1P13164 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IFITM1P13164 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IFITM1P13164 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms