Protein–RNA interactions for Protein: P12838

DEFA4, Neutrophil defensin 4, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA4P12838 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DEFA4P12838 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DEFA4P12838 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DEFA4P12838 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DEFA4P12838 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DEFA4P12838 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DEFA4P12838 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DEFA4P12838 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DEFA4P12838 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DEFA4P12838 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
DEFA4P12838 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DEFA4P12838 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DEFA4P12838 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DEFA4P12838 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DEFA4P12838 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DEFA4P12838 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DEFA4P12838 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DEFA4P12838 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DEFA4P12838 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DEFA4P12838 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
DEFA4P12838 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
DEFA4P12838 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
DEFA4P12838 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
DEFA4P12838 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DEFA4P12838 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DEFA4P12838 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DEFA4P12838 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
DEFA4P12838 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DEFA4P12838 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DEFA4P12838 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DEFA4P12838 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DEFA4P12838 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
DEFA4P12838 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DEFA4P12838 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
DEFA4P12838 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DEFA4P12838 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
DEFA4P12838 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DEFA4P12838 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
DEFA4P12838 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DEFA4P12838 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DEFA4P12838 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DEFA4P12838 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DEFA4P12838 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DEFA4P12838 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DEFA4P12838 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DEFA4P12838 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DEFA4P12838 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DEFA4P12838 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DEFA4P12838 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DEFA4P12838 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DEFA4P12838 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DEFA4P12838 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DEFA4P12838 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
DEFA4P12838 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
DEFA4P12838 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DEFA4P12838 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DEFA4P12838 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DEFA4P12838 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DEFA4P12838 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DEFA4P12838 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DEFA4P12838 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DEFA4P12838 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DEFA4P12838 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DEFA4P12838 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DEFA4P12838 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
DEFA4P12838 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DEFA4P12838 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DEFA4P12838 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DEFA4P12838 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DEFA4P12838 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DEFA4P12838 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DEFA4P12838 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
DEFA4P12838 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DEFA4P12838 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
DEFA4P12838 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DEFA4P12838 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DEFA4P12838 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DEFA4P12838 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DEFA4P12838 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DEFA4P12838 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DEFA4P12838 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
DEFA4P12838 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DEFA4P12838 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DEFA4P12838 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DEFA4P12838 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DEFA4P12838 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DEFA4P12838 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DEFA4P12838 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DEFA4P12838 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
DEFA4P12838 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DEFA4P12838 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DEFA4P12838 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DEFA4P12838 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DEFA4P12838 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
DEFA4P12838 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DEFA4P12838 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DEFA4P12838 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DEFA4P12838 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DEFA4P12838 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DEFA4P12838 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms