Protein–RNA interactions for Protein: P0C263

SBK2, Serine/threonine-protein kinase SBK2, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBK2P0C263 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SBK2P0C263 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SBK2P0C263 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SBK2P0C263 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SBK2P0C263 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SBK2P0C263 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SBK2P0C263 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SBK2P0C263 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SBK2P0C263 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SBK2P0C263 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SBK2P0C263 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SBK2P0C263 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SBK2P0C263 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SBK2P0C263 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SBK2P0C263 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SBK2P0C263 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SBK2P0C263 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SBK2P0C263 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SBK2P0C263 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SBK2P0C263 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SBK2P0C263 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SBK2P0C263 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SBK2P0C263 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SBK2P0C263 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SBK2P0C263 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SBK2P0C263 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SBK2P0C263 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SBK2P0C263 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SBK2P0C263 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SBK2P0C263 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SBK2P0C263 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SBK2P0C263 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SBK2P0C263 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SBK2P0C263 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SBK2P0C263 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SBK2P0C263 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SBK2P0C263 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SBK2P0C263 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SBK2P0C263 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SBK2P0C263 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SBK2P0C263 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SBK2P0C263 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SBK2P0C263 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SBK2P0C263 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SBK2P0C263 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SBK2P0C263 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SBK2P0C263 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SBK2P0C263 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SBK2P0C263 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SBK2P0C263 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SBK2P0C263 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SBK2P0C263 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SBK2P0C263 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SBK2P0C263 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SBK2P0C263 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SBK2P0C263 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SBK2P0C263 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SBK2P0C263 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SBK2P0C263 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SBK2P0C263 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SBK2P0C263 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SBK2P0C263 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SBK2P0C263 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SBK2P0C263 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SBK2P0C263 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SBK2P0C263 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SBK2P0C263 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SBK2P0C263 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SBK2P0C263 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SBK2P0C263 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SBK2P0C263 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SBK2P0C263 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SBK2P0C263 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SBK2P0C263 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SBK2P0C263 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SBK2P0C263 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SBK2P0C263 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SBK2P0C263 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SBK2P0C263 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SBK2P0C263 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SBK2P0C263 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SBK2P0C263 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
SBK2P0C263 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SBK2P0C263 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SBK2P0C263 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SBK2P0C263 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SBK2P0C263 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SBK2P0C263 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SBK2P0C263 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SBK2P0C263 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SBK2P0C263 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SBK2P0C263 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SBK2P0C263 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SBK2P0C263 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SBK2P0C263 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SBK2P0C263 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SBK2P0C263 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SBK2P0C263 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SBK2P0C263 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SBK2P0C263 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms