Protein–RNA interactions for Protein: P06239

LCK, Tyrosine-protein kinase Lck, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCKP06239 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LCKP06239 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LCKP06239 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LCKP06239 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LCKP06239 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LCKP06239 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LCKP06239 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LCKP06239 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LCKP06239 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LCKP06239 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LCKP06239 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LCKP06239 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LCKP06239 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LCKP06239 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LCKP06239 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LCKP06239 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LCKP06239 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LCKP06239 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LCKP06239 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LCKP06239 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LCKP06239 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LCKP06239 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LCKP06239 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LCKP06239 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LCKP06239 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
LCKP06239 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
LCKP06239 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
LCKP06239 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LCKP06239 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LCKP06239 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LCKP06239 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LCKP06239 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LCKP06239 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LCKP06239 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LCKP06239 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LCKP06239 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LCKP06239 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LCKP06239 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LCKP06239 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LCKP06239 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
LCKP06239 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LCKP06239 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LCKP06239 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LCKP06239 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LCKP06239 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LCKP06239 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LCKP06239 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LCKP06239 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LCKP06239 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LCKP06239 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LCKP06239 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LCKP06239 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LCKP06239 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LCKP06239 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LCKP06239 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LCKP06239 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LCKP06239 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LCKP06239 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LCKP06239 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LCKP06239 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LCKP06239 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LCKP06239 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LCKP06239 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LCKP06239 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LCKP06239 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LCKP06239 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LCKP06239 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LCKP06239 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LCKP06239 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LCKP06239 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LCKP06239 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LCKP06239 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LCKP06239 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LCKP06239 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LCKP06239 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LCKP06239 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LCKP06239 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LCKP06239 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LCKP06239 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LCKP06239 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LCKP06239 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
LCKP06239 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LCKP06239 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LCKP06239 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LCKP06239 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LCKP06239 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LCKP06239 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LCKP06239 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LCKP06239 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LCKP06239 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LCKP06239 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LCKP06239 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LCKP06239 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
LCKP06239 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LCKP06239 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
LCKP06239 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LCKP06239 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LCKP06239 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LCKP06239 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LCKP06239 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.1 ms