Protein–RNA interactions for Protein: P05014

IFNA4, Interferon alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA4P05014 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
IFNA4P05014 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
IFNA4P05014 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
IFNA4P05014 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
IFNA4P05014 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
IFNA4P05014 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IFNA4P05014 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
IFNA4P05014 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IFNA4P05014 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IFNA4P05014 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IFNA4P05014 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IFNA4P05014 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IFNA4P05014 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IFNA4P05014 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IFNA4P05014 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
IFNA4P05014 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
IFNA4P05014 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IFNA4P05014 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
IFNA4P05014 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IFNA4P05014 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IFNA4P05014 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IFNA4P05014 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IFNA4P05014 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IFNA4P05014 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IFNA4P05014 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
IFNA4P05014 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IFNA4P05014 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IFNA4P05014 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
IFNA4P05014 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
IFNA4P05014 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
IFNA4P05014 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
IFNA4P05014 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IFNA4P05014 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IFNA4P05014 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IFNA4P05014 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IFNA4P05014 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IFNA4P05014 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IFNA4P05014 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IFNA4P05014 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IFNA4P05014 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IFNA4P05014 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IFNA4P05014 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IFNA4P05014 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
IFNA4P05014 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IFNA4P05014 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
IFNA4P05014 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IFNA4P05014 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
IFNA4P05014 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IFNA4P05014 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
IFNA4P05014 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IFNA4P05014 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
IFNA4P05014 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IFNA4P05014 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IFNA4P05014 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IFNA4P05014 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IFNA4P05014 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
IFNA4P05014 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
IFNA4P05014 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
IFNA4P05014 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IFNA4P05014 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IFNA4P05014 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IFNA4P05014 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IFNA4P05014 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IFNA4P05014 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IFNA4P05014 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IFNA4P05014 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IFNA4P05014 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IFNA4P05014 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IFNA4P05014 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IFNA4P05014 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IFNA4P05014 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IFNA4P05014 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IFNA4P05014 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IFNA4P05014 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IFNA4P05014 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IFNA4P05014 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IFNA4P05014 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IFNA4P05014 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
IFNA4P05014 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
IFNA4P05014 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IFNA4P05014 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IFNA4P05014 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IFNA4P05014 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IFNA4P05014 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IFNA4P05014 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IFNA4P05014 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IFNA4P05014 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IFNA4P05014 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IFNA4P05014 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IFNA4P05014 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IFNA4P05014 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IFNA4P05014 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IFNA4P05014 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IFNA4P05014 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IFNA4P05014 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
IFNA4P05014 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IFNA4P05014 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IFNA4P05014 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IFNA4P05014 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IFNA4P05014 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.6 ms