Protein–RNA interactions for Protein: P04554

PRM2, Protamine-2, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRM2P04554 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PRM2P04554 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PRM2P04554 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PRM2P04554 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PRM2P04554 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PRM2P04554 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PRM2P04554 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PRM2P04554 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PRM2P04554 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PRM2P04554 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PRM2P04554 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PRM2P04554 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
PRM2P04554 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PRM2P04554 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PRM2P04554 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PRM2P04554 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PRM2P04554 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PRM2P04554 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PRM2P04554 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
PRM2P04554 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PRM2P04554 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PRM2P04554 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PRM2P04554 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PRM2P04554 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PRM2P04554 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PRM2P04554 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
PRM2P04554 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PRM2P04554 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PRM2P04554 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PRM2P04554 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PRM2P04554 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PRM2P04554 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PRM2P04554 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PRM2P04554 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PRM2P04554 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PRM2P04554 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PRM2P04554 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PRM2P04554 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRM2P04554 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRM2P04554 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRM2P04554 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRM2P04554 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRM2P04554 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PRM2P04554 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRM2P04554 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PRM2P04554 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRM2P04554 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRM2P04554 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRM2P04554 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRM2P04554 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRM2P04554 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRM2P04554 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRM2P04554 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRM2P04554 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRM2P04554 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRM2P04554 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PRM2P04554 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PRM2P04554 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PRM2P04554 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PRM2P04554 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PRM2P04554 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PRM2P04554 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PRM2P04554 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PRM2P04554 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PRM2P04554 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PRM2P04554 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PRM2P04554 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PRM2P04554 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PRM2P04554 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PRM2P04554 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PRM2P04554 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PRM2P04554 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PRM2P04554 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PRM2P04554 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
PRM2P04554 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PRM2P04554 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PRM2P04554 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
PRM2P04554 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PRM2P04554 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PRM2P04554 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PRM2P04554 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PRM2P04554 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PRM2P04554 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PRM2P04554 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PRM2P04554 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PRM2P04554 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PRM2P04554 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PRM2P04554 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PRM2P04554 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PRM2P04554 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PRM2P04554 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PRM2P04554 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PRM2P04554 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PRM2P04554 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PRM2P04554 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PRM2P04554 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PRM2P04554 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PRM2P04554 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PRM2P04554 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PRM2P04554 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.8 ms