Protein–RNA interactions for Protein: P04183

TK1, Thymidine kinase, cytosolic, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TK1P04183 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TK1P04183 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TK1P04183 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TK1P04183 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TK1P04183 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TK1P04183 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TK1P04183 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TK1P04183 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TK1P04183 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TK1P04183 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TK1P04183 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TK1P04183 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TK1P04183 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TK1P04183 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TK1P04183 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TK1P04183 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TK1P04183 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TK1P04183 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TK1P04183 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TK1P04183 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TK1P04183 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TK1P04183 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TK1P04183 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TK1P04183 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TK1P04183 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TK1P04183 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TK1P04183 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TK1P04183 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TK1P04183 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TK1P04183 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TK1P04183 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TK1P04183 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TK1P04183 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TK1P04183 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TK1P04183 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TK1P04183 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TK1P04183 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TK1P04183 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TK1P04183 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TK1P04183 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TK1P04183 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TK1P04183 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TK1P04183 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TK1P04183 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TK1P04183 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TK1P04183 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TK1P04183 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TK1P04183 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TK1P04183 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TK1P04183 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TK1P04183 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TK1P04183 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TK1P04183 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TK1P04183 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TK1P04183 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TK1P04183 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TK1P04183 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TK1P04183 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TK1P04183 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TK1P04183 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TK1P04183 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TK1P04183 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TK1P04183 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TK1P04183 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TK1P04183 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TK1P04183 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TK1P04183 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TK1P04183 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TK1P04183 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TK1P04183 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TK1P04183 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TK1P04183 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TK1P04183 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TK1P04183 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TK1P04183 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TK1P04183 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TK1P04183 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TK1P04183 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TK1P04183 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TK1P04183 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TK1P04183 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TK1P04183 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TK1P04183 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TK1P04183 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TK1P04183 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TK1P04183 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TK1P04183 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TK1P04183 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TK1P04183 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TK1P04183 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TK1P04183 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TK1P04183 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TK1P04183 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TK1P04183 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TK1P04183 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TK1P04183 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TK1P04183 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TK1P04183 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TK1P04183 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TK1P04183 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms