Protein–RNA interactions for Protein: P02545

LMNA, Prelamin-A/C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNAP02545 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LMNAP02545 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LMNAP02545 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LMNAP02545 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LMNAP02545 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
LMNAP02545 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LMNAP02545 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LMNAP02545 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LMNAP02545 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LMNAP02545 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LMNAP02545 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LMNAP02545 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LMNAP02545 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LMNAP02545 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LMNAP02545 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
LMNAP02545 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.56■■■□□ 2
LMNAP02545 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LMNAP02545 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LMNAP02545 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LMNAP02545 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
LMNAP02545 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.54■■■□□ 2
LMNAP02545 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
LMNAP02545 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LMNAP02545 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.53■■■□□ 2
LMNAP02545 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.53■■■□□ 2
LMNAP02545 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LMNAP02545 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LMNAP02545 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LMNAP02545 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LMNAP02545 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LMNAP02545 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LMNAP02545 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LMNAP02545 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
LMNAP02545 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LMNAP02545 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LMNAP02545 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
LMNAP02545 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LMNAP02545 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
LMNAP02545 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
LMNAP02545 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
LMNAP02545 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LMNAP02545 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LMNAP02545 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LMNAP02545 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LMNAP02545 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LMNAP02545 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
LMNAP02545 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LMNAP02545 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LMNAP02545 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LMNAP02545 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LMNAP02545 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LMNAP02545 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
LMNAP02545 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
LMNAP02545 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LMNAP02545 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LMNAP02545 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LMNAP02545 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LMNAP02545 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LMNAP02545 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LMNAP02545 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LMNAP02545 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LMNAP02545 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LMNAP02545 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LMNAP02545 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LMNAP02545 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LMNAP02545 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LMNAP02545 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LMNAP02545 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LMNAP02545 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LMNAP02545 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LMNAP02545 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LMNAP02545 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LMNAP02545 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
LMNAP02545 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LMNAP02545 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LMNAP02545 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LMNAP02545 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LMNAP02545 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LMNAP02545 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
LMNAP02545 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LMNAP02545 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LMNAP02545 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LMNAP02545 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LMNAP02545 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LMNAP02545 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LMNAP02545 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LMNAP02545 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LMNAP02545 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
LMNAP02545 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LMNAP02545 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
LMNAP02545 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
LMNAP02545 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LMNAP02545 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LMNAP02545 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LMNAP02545 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LMNAP02545 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
LMNAP02545 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LMNAP02545 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LMNAP02545 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
LMNAP02545 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms