Protein–RNA interactions for Protein: P02100

HBE1, Hemoglobin subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBE1P02100 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
HBE1P02100 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HBE1P02100 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.31■■□□□ 1
HBE1P02100 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HBE1P02100 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HBE1P02100 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HBE1P02100 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC21.3■■□□□ 1
HBE1P02100 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HBE1P02100 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HBE1P02100 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HBE1P02100 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HBE1P02100 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HBE1P02100 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HBE1P02100 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HBE1P02100 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HBE1P02100 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HBE1P02100 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HBE1P02100 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
HBE1P02100 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HBE1P02100 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HBE1P02100 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HBE1P02100 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HBE1P02100 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HBE1P02100 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HBE1P02100 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HBE1P02100 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HBE1P02100 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HBE1P02100 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HBE1P02100 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HBE1P02100 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HBE1P02100 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HBE1P02100 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HBE1P02100 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HBE1P02100 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HBE1P02100 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
HBE1P02100 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HBE1P02100 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HBE1P02100 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HBE1P02100 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HBE1P02100 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HBE1P02100 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HBE1P02100 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HBE1P02100 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HBE1P02100 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HBE1P02100 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HBE1P02100 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HBE1P02100 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HBE1P02100 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
HBE1P02100 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
HBE1P02100 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HBE1P02100 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HBE1P02100 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HBE1P02100 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HBE1P02100 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HBE1P02100 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HBE1P02100 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HBE1P02100 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HBE1P02100 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HBE1P02100 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HBE1P02100 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HBE1P02100 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HBE1P02100 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HBE1P02100 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HBE1P02100 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
HBE1P02100 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HBE1P02100 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HBE1P02100 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HBE1P02100 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HBE1P02100 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HBE1P02100 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HBE1P02100 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HBE1P02100 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HBE1P02100 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HBE1P02100 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
HBE1P02100 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HBE1P02100 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HBE1P02100 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HBE1P02100 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HBE1P02100 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HBE1P02100 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HBE1P02100 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HBE1P02100 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HBE1P02100 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HBE1P02100 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HBE1P02100 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HBE1P02100 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HBE1P02100 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HBE1P02100 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HBE1P02100 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HBE1P02100 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HBE1P02100 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HBE1P02100 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HBE1P02100 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HBE1P02100 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HBE1P02100 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HBE1P02100 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HBE1P02100 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HBE1P02100 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HBE1P02100 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HBE1P02100 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms