Protein–RNA interactions for Protein: O95231

VENTX, Homeobox protein VENTX, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VENTXO95231 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VENTXO95231 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VENTXO95231 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VENTXO95231 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
VENTXO95231 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VENTXO95231 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VENTXO95231 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VENTXO95231 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VENTXO95231 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VENTXO95231 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VENTXO95231 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VENTXO95231 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VENTXO95231 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VENTXO95231 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VENTXO95231 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VENTXO95231 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VENTXO95231 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VENTXO95231 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VENTXO95231 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
VENTXO95231 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
VENTXO95231 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VENTXO95231 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VENTXO95231 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VENTXO95231 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VENTXO95231 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VENTXO95231 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VENTXO95231 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VENTXO95231 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
VENTXO95231 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VENTXO95231 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VENTXO95231 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VENTXO95231 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VENTXO95231 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VENTXO95231 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VENTXO95231 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VENTXO95231 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VENTXO95231 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VENTXO95231 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VENTXO95231 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
VENTXO95231 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
VENTXO95231 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
VENTXO95231 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VENTXO95231 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VENTXO95231 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VENTXO95231 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VENTXO95231 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VENTXO95231 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VENTXO95231 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VENTXO95231 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VENTXO95231 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VENTXO95231 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VENTXO95231 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VENTXO95231 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VENTXO95231 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VENTXO95231 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
VENTXO95231 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VENTXO95231 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
VENTXO95231 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VENTXO95231 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VENTXO95231 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
VENTXO95231 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VENTXO95231 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VENTXO95231 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
VENTXO95231 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VENTXO95231 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
VENTXO95231 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
VENTXO95231 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
VENTXO95231 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VENTXO95231 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VENTXO95231 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VENTXO95231 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VENTXO95231 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VENTXO95231 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VENTXO95231 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VENTXO95231 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
VENTXO95231 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VENTXO95231 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
VENTXO95231 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VENTXO95231 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VENTXO95231 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VENTXO95231 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VENTXO95231 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VENTXO95231 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VENTXO95231 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VENTXO95231 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VENTXO95231 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VENTXO95231 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VENTXO95231 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VENTXO95231 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VENTXO95231 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VENTXO95231 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
VENTXO95231 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VENTXO95231 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
VENTXO95231 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VENTXO95231 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VENTXO95231 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VENTXO95231 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
VENTXO95231 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VENTXO95231 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VENTXO95231 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms