Protein–RNA interactions for Protein: O95199

RCBTB2, RCC1 and BTB domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCBTB2O95199 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RCBTB2O95199 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RCBTB2O95199 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RCBTB2O95199 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RCBTB2O95199 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RCBTB2O95199 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RCBTB2O95199 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RCBTB2O95199 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RCBTB2O95199 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RCBTB2O95199 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RCBTB2O95199 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RCBTB2O95199 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RCBTB2O95199 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RCBTB2O95199 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RCBTB2O95199 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RCBTB2O95199 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
RCBTB2O95199 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RCBTB2O95199 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RCBTB2O95199 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RCBTB2O95199 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
RCBTB2O95199 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RCBTB2O95199 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RCBTB2O95199 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RCBTB2O95199 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
RCBTB2O95199 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RCBTB2O95199 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RCBTB2O95199 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RCBTB2O95199 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RCBTB2O95199 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
RCBTB2O95199 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RCBTB2O95199 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RCBTB2O95199 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RCBTB2O95199 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RCBTB2O95199 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RCBTB2O95199 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RCBTB2O95199 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RCBTB2O95199 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RCBTB2O95199 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RCBTB2O95199 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
RCBTB2O95199 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RCBTB2O95199 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RCBTB2O95199 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RCBTB2O95199 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RCBTB2O95199 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RCBTB2O95199 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
RCBTB2O95199 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
RCBTB2O95199 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RCBTB2O95199 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RCBTB2O95199 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RCBTB2O95199 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RCBTB2O95199 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RCBTB2O95199 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RCBTB2O95199 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RCBTB2O95199 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RCBTB2O95199 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RCBTB2O95199 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RCBTB2O95199 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RCBTB2O95199 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RCBTB2O95199 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RCBTB2O95199 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RCBTB2O95199 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RCBTB2O95199 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RCBTB2O95199 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RCBTB2O95199 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RCBTB2O95199 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RCBTB2O95199 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RCBTB2O95199 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RCBTB2O95199 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RCBTB2O95199 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RCBTB2O95199 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RCBTB2O95199 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RCBTB2O95199 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RCBTB2O95199 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RCBTB2O95199 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RCBTB2O95199 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RCBTB2O95199 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RCBTB2O95199 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RCBTB2O95199 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RCBTB2O95199 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RCBTB2O95199 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RCBTB2O95199 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RCBTB2O95199 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RCBTB2O95199 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RCBTB2O95199 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RCBTB2O95199 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RCBTB2O95199 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RCBTB2O95199 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RCBTB2O95199 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RCBTB2O95199 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RCBTB2O95199 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RCBTB2O95199 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RCBTB2O95199 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RCBTB2O95199 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RCBTB2O95199 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RCBTB2O95199 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RCBTB2O95199 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RCBTB2O95199 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RCBTB2O95199 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RCBTB2O95199 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RCBTB2O95199 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms