Protein–RNA interactions for Protein: O94953

KDM4B, Lysine-specific demethylase 4B, humanhuman

Predictions only

Length 1,096 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM4BO94953 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KDM4BO94953 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KDM4BO94953 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KDM4BO94953 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KDM4BO94953 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KDM4BO94953 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KDM4BO94953 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KDM4BO94953 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KDM4BO94953 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
KDM4BO94953 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KDM4BO94953 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KDM4BO94953 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KDM4BO94953 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KDM4BO94953 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KDM4BO94953 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KDM4BO94953 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KDM4BO94953 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KDM4BO94953 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KDM4BO94953 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KDM4BO94953 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDM4BO94953 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDM4BO94953 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDM4BO94953 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDM4BO94953 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDM4BO94953 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KDM4BO94953 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KDM4BO94953 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KDM4BO94953 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KDM4BO94953 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KDM4BO94953 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KDM4BO94953 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KDM4BO94953 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KDM4BO94953 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KDM4BO94953 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KDM4BO94953 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KDM4BO94953 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KDM4BO94953 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KDM4BO94953 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KDM4BO94953 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KDM4BO94953 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KDM4BO94953 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KDM4BO94953 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KDM4BO94953 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDM4BO94953 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDM4BO94953 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KDM4BO94953 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KDM4BO94953 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KDM4BO94953 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KDM4BO94953 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KDM4BO94953 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KDM4BO94953 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KDM4BO94953 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDM4BO94953 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDM4BO94953 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDM4BO94953 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDM4BO94953 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KDM4BO94953 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KDM4BO94953 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KDM4BO94953 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KDM4BO94953 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KDM4BO94953 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KDM4BO94953 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KDM4BO94953 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KDM4BO94953 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KDM4BO94953 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KDM4BO94953 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KDM4BO94953 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KDM4BO94953 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KDM4BO94953 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KDM4BO94953 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KDM4BO94953 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KDM4BO94953 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KDM4BO94953 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KDM4BO94953 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KDM4BO94953 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KDM4BO94953 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KDM4BO94953 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KDM4BO94953 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KDM4BO94953 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDM4BO94953 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDM4BO94953 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM4BO94953 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM4BO94953 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM4BO94953 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KDM4BO94953 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KDM4BO94953 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KDM4BO94953 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KDM4BO94953 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KDM4BO94953 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KDM4BO94953 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KDM4BO94953 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KDM4BO94953 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
KDM4BO94953 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
KDM4BO94953 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM4BO94953 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM4BO94953 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM4BO94953 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM4BO94953 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM4BO94953 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM4BO94953 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms