Protein–RNA interactions for Protein: O75695

RP2, Protein XRP2, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RP2O75695 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RP2O75695 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RP2O75695 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RP2O75695 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RP2O75695 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RP2O75695 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RP2O75695 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RP2O75695 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RP2O75695 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RP2O75695 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RP2O75695 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RP2O75695 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RP2O75695 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RP2O75695 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RP2O75695 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RP2O75695 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RP2O75695 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RP2O75695 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RP2O75695 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RP2O75695 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RP2O75695 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RP2O75695 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RP2O75695 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RP2O75695 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RP2O75695 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
RP2O75695 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RP2O75695 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23■■□□□ 1.27
RP2O75695 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23■■□□□ 1.27
RP2O75695 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RP2O75695 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RP2O75695 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RP2O75695 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RP2O75695 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RP2O75695 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
RP2O75695 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RP2O75695 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
RP2O75695 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RP2O75695 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RP2O75695 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RP2O75695 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RP2O75695 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RP2O75695 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RP2O75695 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RP2O75695 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RP2O75695 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RP2O75695 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RP2O75695 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RP2O75695 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
RP2O75695 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RP2O75695 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RP2O75695 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RP2O75695 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RP2O75695 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RP2O75695 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RP2O75695 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RP2O75695 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RP2O75695 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RP2O75695 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RP2O75695 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RP2O75695 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RP2O75695 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RP2O75695 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RP2O75695 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RP2O75695 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RP2O75695 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RP2O75695 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RP2O75695 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RP2O75695 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RP2O75695 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RP2O75695 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RP2O75695 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RP2O75695 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RP2O75695 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RP2O75695 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RP2O75695 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RP2O75695 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RP2O75695 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RP2O75695 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RP2O75695 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RP2O75695 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RP2O75695 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RP2O75695 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RP2O75695 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RP2O75695 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RP2O75695 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RP2O75695 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RP2O75695 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RP2O75695 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RP2O75695 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RP2O75695 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RP2O75695 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RP2O75695 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RP2O75695 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RP2O75695 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RP2O75695 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RP2O75695 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RP2O75695 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RP2O75695 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RP2O75695 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RP2O75695 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms