Protein–RNA interactions for Protein: O43920

NDUFS5, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS5O43920 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NDUFS5O43920 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NDUFS5O43920 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NDUFS5O43920 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NDUFS5O43920 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NDUFS5O43920 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NDUFS5O43920 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NDUFS5O43920 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NDUFS5O43920 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NDUFS5O43920 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NDUFS5O43920 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NDUFS5O43920 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NDUFS5O43920 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
NDUFS5O43920 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NDUFS5O43920 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NDUFS5O43920 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NDUFS5O43920 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NDUFS5O43920 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NDUFS5O43920 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NDUFS5O43920 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NDUFS5O43920 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NDUFS5O43920 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NDUFS5O43920 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDUFS5O43920 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDUFS5O43920 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDUFS5O43920 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDUFS5O43920 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NDUFS5O43920 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NDUFS5O43920 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NDUFS5O43920 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NDUFS5O43920 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NDUFS5O43920 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NDUFS5O43920 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NDUFS5O43920 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDUFS5O43920 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDUFS5O43920 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDUFS5O43920 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NDUFS5O43920 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NDUFS5O43920 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NDUFS5O43920 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NDUFS5O43920 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDUFS5O43920 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDUFS5O43920 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDUFS5O43920 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDUFS5O43920 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDUFS5O43920 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDUFS5O43920 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NDUFS5O43920 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDUFS5O43920 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDUFS5O43920 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDUFS5O43920 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDUFS5O43920 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDUFS5O43920 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDUFS5O43920 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDUFS5O43920 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDUFS5O43920 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDUFS5O43920 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDUFS5O43920 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NDUFS5O43920 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NDUFS5O43920 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NDUFS5O43920 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDUFS5O43920 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDUFS5O43920 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDUFS5O43920 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NDUFS5O43920 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NDUFS5O43920 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NDUFS5O43920 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDUFS5O43920 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDUFS5O43920 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NDUFS5O43920 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDUFS5O43920 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFS5O43920 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFS5O43920 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFS5O43920 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFS5O43920 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFS5O43920 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFS5O43920 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFS5O43920 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFS5O43920 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDUFS5O43920 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDUFS5O43920 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDUFS5O43920 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDUFS5O43920 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDUFS5O43920 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NDUFS5O43920 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NDUFS5O43920 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NDUFS5O43920 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDUFS5O43920 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDUFS5O43920 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDUFS5O43920 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDUFS5O43920 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDUFS5O43920 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDUFS5O43920 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFS5O43920 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFS5O43920 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFS5O43920 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFS5O43920 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFS5O43920 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFS5O43920 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFS5O43920 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms