RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613246.4

PTPRJ-207, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRJ, Length 7,851 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-207ENST00000613246 DCAF8L2P0C7V8 631 aa31.01■■■□□ 2.56
PTPRJ-207ENST00000613246 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP30.57■■■□□ 2.48
PTPRJ-207ENST00000613246 ERICH6Q7L0X2 663 aa29.59■■■□□ 2.33
PTPRJ-207ENST00000613246 EHMT2Q96KQ7 1210 aa29.42■■■□□ 2.3
PTPRJ-207ENST00000613246 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP29.31■■■□□ 2.28
PTPRJ-207ENST00000613246 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP29.18■■■□□ 2.26
PTPRJ-207ENST00000613246 APLP2Q06481 763 aa28.91■■■□□ 2.22
PTPRJ-207ENST00000613246 MYT1Q01538 1121 aa28.7■■■□□ 2.18
PTPRJ-207ENST00000613246 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP28.6■■■□□ 2.17
PTPRJ-207ENST00000613246 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP28.51■■■□□ 2.16
PTPRJ-207ENST00000613246 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP28.51■■■□□ 2.15
PTPRJ-207ENST00000613246 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa28.4■■■□□ 2.14
PTPRJ-207ENST00000613246 NEFLP07196 543 aa28.3■■■□□ 2.12
PTPRJ-207ENST00000613246 PCGF6Q9BYE7 350 aa28.29■■■□□ 2.12
PTPRJ-207ENST00000613246 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP28.09■■■□□ 2.09
PTPRJ-207ENST00000613246 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP27.99■■■□□ 2.07
PTPRJ-207ENST00000613246 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP27.93■■■□□ 2.06
PTPRJ-207ENST00000613246 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP27.92■■■□□ 2.06
PTPRJ-207ENST00000613246 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP27.81■■■□□ 2.04
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PTPRJ-207ENST00000613246 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP27.08■■□□□ 1.93
PTPRJ-207ENST00000613246 MYT1LQ9UL68 1186 aa27.07■■□□□ 1.92
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PTPRJ-207ENST00000613246 ITGAEP38570 1179 aa26.71■■□□□ 1.87
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PTPRJ-207ENST00000613246 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP26.47■■□□□ 1.83
PTPRJ-207ENST00000613246 HRCP23327 699 aa26.43■■□□□ 1.82
PTPRJ-207ENST00000613246 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP26.42■■□□□ 1.82
PTPRJ-207ENST00000613246 BCL11AQ9H165 835 aa26.41■■□□□ 1.82
PTPRJ-207ENST00000613246 SLC24A1O60721 1099 aa26.34■■□□□ 1.81
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PTPRJ-207ENST00000613246 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP26.23■■□□□ 1.79
PTPRJ-207ENST00000613246 BCANQ96GW7 911 aa26.2■■□□□ 1.78
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PTPRJ-207ENST00000613246 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa26.03■■□□□ 1.76
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PTPRJ-207ENST00000613246 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP25.84■■□□□ 1.73
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PTPRJ-207ENST00000613246 NEUROD1Q13562 356 aa25.8■■□□□ 1.72
PTPRJ-207ENST00000613246 ANP32CO43423 234 aa25.79■■□□□ 1.72
PTPRJ-207ENST00000613246 TRIM52Q96A61 297 aa25.79■■□□□ 1.72
PTPRJ-207ENST00000613246 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP25.78■■□□□ 1.72
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PTPRJ-207ENST00000613246 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP25.7■■□□□ 1.7
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PTPRJ-207ENST00000613246 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
PTPRJ-207ENST00000613246 FKBP8Q14318 412 aa25.13■■□□□ 1.61
PTPRJ-207ENST00000613246 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
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PTPRJ-207ENST00000613246 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP25.01■■□□□ 1.59
PTPRJ-207ENST00000613246 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
PTPRJ-207ENST00000613246 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP24.95■■□□□ 1.58
PTPRJ-207ENST00000613246 PLPPR3Q6T4P5 718 aa24.92■■□□□ 1.58
PTPRJ-207ENST00000613246 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
PTPRJ-207ENST00000613246 NCLP19338 710 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
PTPRJ-207ENST00000613246 CCDC136Q96JN2 1154 aa24.9■■□□□ 1.58
PTPRJ-207ENST00000613246 FAM9BQ8IZU0 186 aa24.87■■□□□ 1.57
PTPRJ-207ENST00000613246 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP24.87■■□□□ 1.57
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PTPRJ-207ENST00000613246 MYH16Q9H6N6 1097 aa24.83■■□□□ 1.57
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PTPRJ-207ENST00000613246 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
PTPRJ-207ENST00000613246 TPRNQ4KMQ1 711 aa24.79■■□□□ 1.56
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PTPRJ-207ENST00000613246 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
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PTPRJ-207ENST00000613246 ARID3CA6NKF2 412 aa24.7■■□□□ 1.54
PTPRJ-207ENST00000613246 TMC1Q8TDI8 760 aa24.7■■□□□ 1.54
PTPRJ-207ENST00000613246 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
PTPRJ-207ENST00000613246 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP24.69■■□□□ 1.54
PTPRJ-207ENST00000613246 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP24.67■■□□□ 1.54
PTPRJ-207ENST00000613246 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP24.67■■□□□ 1.54
PTPRJ-207ENST00000613246 ANP32EQ9BTT0 268 aa24.66■■□□□ 1.54
PTPRJ-207ENST00000613246 DDRGK1Q96HY6 314 aa24.64■■□□□ 1.53
PTPRJ-207ENST00000613246 TONSLQ96HA7 1378 aa24.56■■□□□ 1.52
PTPRJ-207ENST00000613246 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP24.55■■□□□ 1.52
PTPRJ-207ENST00000613246 TAOK2Q9UL54 1235 aa24.53■■□□□ 1.52
PTPRJ-207ENST00000613246 P3H3Q8IVL6 736 aa24.53■■□□□ 1.52
PTPRJ-207ENST00000613246 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
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