Protein–RNA interactions for Protein: O43396

TXNL1, Thioredoxin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNL1O43396 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TXNL1O43396 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TXNL1O43396 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TXNL1O43396 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TXNL1O43396 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TXNL1O43396 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TXNL1O43396 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TXNL1O43396 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TXNL1O43396 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TXNL1O43396 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TXNL1O43396 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TXNL1O43396 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TXNL1O43396 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TXNL1O43396 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TXNL1O43396 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TXNL1O43396 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TXNL1O43396 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TXNL1O43396 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TXNL1O43396 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TXNL1O43396 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TXNL1O43396 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TXNL1O43396 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TXNL1O43396 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TXNL1O43396 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TXNL1O43396 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TXNL1O43396 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TXNL1O43396 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TXNL1O43396 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TXNL1O43396 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TXNL1O43396 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TXNL1O43396 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TXNL1O43396 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TXNL1O43396 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TXNL1O43396 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TXNL1O43396 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TXNL1O43396 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TXNL1O43396 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TXNL1O43396 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TXNL1O43396 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TXNL1O43396 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TXNL1O43396 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TXNL1O43396 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TXNL1O43396 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TXNL1O43396 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TXNL1O43396 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TXNL1O43396 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TXNL1O43396 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TXNL1O43396 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TXNL1O43396 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TXNL1O43396 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TXNL1O43396 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TXNL1O43396 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TXNL1O43396 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TXNL1O43396 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TXNL1O43396 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TXNL1O43396 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TXNL1O43396 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TXNL1O43396 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TXNL1O43396 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TXNL1O43396 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TXNL1O43396 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TXNL1O43396 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TXNL1O43396 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TXNL1O43396 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TXNL1O43396 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TXNL1O43396 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TXNL1O43396 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TXNL1O43396 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TXNL1O43396 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TXNL1O43396 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TXNL1O43396 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TXNL1O43396 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TXNL1O43396 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TXNL1O43396 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TXNL1O43396 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TXNL1O43396 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TXNL1O43396 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TXNL1O43396 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TXNL1O43396 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TXNL1O43396 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TXNL1O43396 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TXNL1O43396 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TXNL1O43396 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TXNL1O43396 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TXNL1O43396 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TXNL1O43396 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TXNL1O43396 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TXNL1O43396 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TXNL1O43396 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TXNL1O43396 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TXNL1O43396 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TXNL1O43396 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TXNL1O43396 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TXNL1O43396 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TXNL1O43396 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TXNL1O43396 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TXNL1O43396 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TXNL1O43396 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TXNL1O43396 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TXNL1O43396 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms