Protein–RNA interactions for Protein: O15079

SNPH, Syntaphilin, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNPHO15079 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNPHO15079 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNPHO15079 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNPHO15079 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNPHO15079 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNPHO15079 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNPHO15079 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNPHO15079 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNPHO15079 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SNPHO15079 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNPHO15079 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNPHO15079 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNPHO15079 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNPHO15079 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SNPHO15079 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNPHO15079 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNPHO15079 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNPHO15079 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNPHO15079 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNPHO15079 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNPHO15079 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNPHO15079 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNPHO15079 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SNPHO15079 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SNPHO15079 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SNPHO15079 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SNPHO15079 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNPHO15079 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNPHO15079 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNPHO15079 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNPHO15079 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SNPHO15079 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNPHO15079 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNPHO15079 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNPHO15079 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNPHO15079 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNPHO15079 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SNPHO15079 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SNPHO15079 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SNPHO15079 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SNPHO15079 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNPHO15079 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNPHO15079 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNPHO15079 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNPHO15079 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNPHO15079 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNPHO15079 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNPHO15079 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SNPHO15079 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SNPHO15079 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNPHO15079 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNPHO15079 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNPHO15079 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNPHO15079 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNPHO15079 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNPHO15079 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNPHO15079 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNPHO15079 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNPHO15079 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNPHO15079 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNPHO15079 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNPHO15079 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SNPHO15079 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SNPHO15079 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNPHO15079 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SNPHO15079 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNPHO15079 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNPHO15079 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNPHO15079 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNPHO15079 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNPHO15079 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNPHO15079 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNPHO15079 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SNPHO15079 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SNPHO15079 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SNPHO15079 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNPHO15079 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SNPHO15079 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNPHO15079 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNPHO15079 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNPHO15079 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNPHO15079 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNPHO15079 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNPHO15079 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SNPHO15079 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNPHO15079 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNPHO15079 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNPHO15079 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNPHO15079 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNPHO15079 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNPHO15079 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SNPHO15079 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNPHO15079 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SNPHO15079 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNPHO15079 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNPHO15079 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SNPHO15079 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SNPHO15079 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SNPHO15079 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SNPHO15079 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms