Protein–RNA interactions for Protein: O14958

CASQ2, Calsequestrin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ2O14958 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CASQ2O14958 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CASQ2O14958 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CASQ2O14958 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CASQ2O14958 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CASQ2O14958 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CASQ2O14958 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CASQ2O14958 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CASQ2O14958 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CASQ2O14958 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CASQ2O14958 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CASQ2O14958 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CASQ2O14958 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CASQ2O14958 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CASQ2O14958 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CASQ2O14958 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CASQ2O14958 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CASQ2O14958 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CASQ2O14958 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CASQ2O14958 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CASQ2O14958 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CASQ2O14958 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CASQ2O14958 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CASQ2O14958 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CASQ2O14958 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CASQ2O14958 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CASQ2O14958 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CASQ2O14958 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CASQ2O14958 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CASQ2O14958 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CASQ2O14958 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CASQ2O14958 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CASQ2O14958 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CASQ2O14958 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CASQ2O14958 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CASQ2O14958 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CASQ2O14958 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CASQ2O14958 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CASQ2O14958 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CASQ2O14958 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CASQ2O14958 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CASQ2O14958 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CASQ2O14958 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CASQ2O14958 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CASQ2O14958 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CASQ2O14958 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CASQ2O14958 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CASQ2O14958 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CASQ2O14958 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CASQ2O14958 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CASQ2O14958 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CASQ2O14958 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CASQ2O14958 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CASQ2O14958 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CASQ2O14958 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CASQ2O14958 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CASQ2O14958 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CASQ2O14958 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CASQ2O14958 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CASQ2O14958 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CASQ2O14958 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CASQ2O14958 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CASQ2O14958 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CASQ2O14958 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CASQ2O14958 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CASQ2O14958 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CASQ2O14958 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CASQ2O14958 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CASQ2O14958 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CASQ2O14958 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CASQ2O14958 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CASQ2O14958 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CASQ2O14958 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CASQ2O14958 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CASQ2O14958 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CASQ2O14958 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CASQ2O14958 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CASQ2O14958 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CASQ2O14958 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CASQ2O14958 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CASQ2O14958 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CASQ2O14958 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CASQ2O14958 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CASQ2O14958 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CASQ2O14958 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CASQ2O14958 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CASQ2O14958 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CASQ2O14958 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CASQ2O14958 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CASQ2O14958 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CASQ2O14958 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CASQ2O14958 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CASQ2O14958 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CASQ2O14958 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CASQ2O14958 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CASQ2O14958 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CASQ2O14958 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CASQ2O14958 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CASQ2O14958 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CASQ2O14958 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms