Protein–RNA interactions for Protein: O14874

BCKDK, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDKO14874 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BCKDKO14874 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BCKDKO14874 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BCKDKO14874 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BCKDKO14874 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BCKDKO14874 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
BCKDKO14874 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BCKDKO14874 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BCKDKO14874 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BCKDKO14874 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BCKDKO14874 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BCKDKO14874 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BCKDKO14874 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BCKDKO14874 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BCKDKO14874 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
BCKDKO14874 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BCKDKO14874 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BCKDKO14874 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
BCKDKO14874 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BCKDKO14874 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BCKDKO14874 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BCKDKO14874 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BCKDKO14874 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BCKDKO14874 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BCKDKO14874 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BCKDKO14874 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BCKDKO14874 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
BCKDKO14874 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BCKDKO14874 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BCKDKO14874 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BCKDKO14874 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BCKDKO14874 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BCKDKO14874 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BCKDKO14874 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
BCKDKO14874 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BCKDKO14874 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BCKDKO14874 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BCKDKO14874 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BCKDKO14874 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BCKDKO14874 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BCKDKO14874 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BCKDKO14874 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BCKDKO14874 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BCKDKO14874 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BCKDKO14874 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BCKDKO14874 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BCKDKO14874 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
BCKDKO14874 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
BCKDKO14874 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
BCKDKO14874 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BCKDKO14874 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BCKDKO14874 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
BCKDKO14874 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BCKDKO14874 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BCKDKO14874 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BCKDKO14874 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BCKDKO14874 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BCKDKO14874 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BCKDKO14874 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BCKDKO14874 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BCKDKO14874 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BCKDKO14874 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
BCKDKO14874 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BCKDKO14874 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BCKDKO14874 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BCKDKO14874 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
BCKDKO14874 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BCKDKO14874 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BCKDKO14874 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BCKDKO14874 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BCKDKO14874 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BCKDKO14874 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
BCKDKO14874 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BCKDKO14874 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
BCKDKO14874 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BCKDKO14874 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BCKDKO14874 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BCKDKO14874 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BCKDKO14874 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BCKDKO14874 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BCKDKO14874 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
BCKDKO14874 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BCKDKO14874 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BCKDKO14874 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BCKDKO14874 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BCKDKO14874 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BCKDKO14874 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BCKDKO14874 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BCKDKO14874 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BCKDKO14874 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BCKDKO14874 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BCKDKO14874 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BCKDKO14874 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BCKDKO14874 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BCKDKO14874 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BCKDKO14874 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BCKDKO14874 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BCKDKO14874 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BCKDKO14874 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BCKDKO14874 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms